Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PalldQ9ET54 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PalldQ9ET54 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PalldQ9ET54 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PalldQ9ET54 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PalldQ9ET54 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PalldQ9ET54 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PalldQ9ET54 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PalldQ9ET54 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PalldQ9ET54 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PalldQ9ET54 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PalldQ9ET54 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PalldQ9ET54 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PalldQ9ET54 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PalldQ9ET54 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
PalldQ9ET54 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PalldQ9ET54 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PalldQ9ET54 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
PalldQ9ET54 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
PalldQ9ET54 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PalldQ9ET54 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PalldQ9ET54 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
PalldQ9ET54 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PalldQ9ET54 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
PalldQ9ET54 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PalldQ9ET54 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PalldQ9ET54 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
PalldQ9ET54 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PalldQ9ET54 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PalldQ9ET54 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PalldQ9ET54 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PalldQ9ET54 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PalldQ9ET54 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PalldQ9ET54 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
PalldQ9ET54 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PalldQ9ET54 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
PalldQ9ET54 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PalldQ9ET54 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PalldQ9ET54 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PalldQ9ET54 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PalldQ9ET54 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
PalldQ9ET54 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PalldQ9ET54 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PalldQ9ET54 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PalldQ9ET54 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PalldQ9ET54 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PalldQ9ET54 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PalldQ9ET54 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PalldQ9ET54 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
PalldQ9ET54 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
PalldQ9ET54 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PalldQ9ET54 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PalldQ9ET54 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PalldQ9ET54 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PalldQ9ET54 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PalldQ9ET54 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PalldQ9ET54 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PalldQ9ET54 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PalldQ9ET54 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PalldQ9ET54 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PalldQ9ET54 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PalldQ9ET54 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PalldQ9ET54 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PalldQ9ET54 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PalldQ9ET54 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PalldQ9ET54 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PalldQ9ET54 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PalldQ9ET54 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
PalldQ9ET54 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PalldQ9ET54 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PalldQ9ET54 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PalldQ9ET54 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PalldQ9ET54 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PalldQ9ET54 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PalldQ9ET54 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
PalldQ9ET54 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PalldQ9ET54 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PalldQ9ET54 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PalldQ9ET54 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PalldQ9ET54 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PalldQ9ET54 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PalldQ9ET54 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PalldQ9ET54 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PalldQ9ET54 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PalldQ9ET54 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
PalldQ9ET54 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PalldQ9ET54 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PalldQ9ET54 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PalldQ9ET54 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PalldQ9ET54 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PalldQ9ET54 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PalldQ9ET54 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PalldQ9ET54 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PalldQ9ET54 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PalldQ9ET54 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PalldQ9ET54 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.7
PalldQ9ET54 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PalldQ9ET54 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PalldQ9ET54 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PalldQ9ET54 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms