Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERC3

Sertad3, SERTA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sertad3Q9ERC3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sertad3Q9ERC3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sertad3Q9ERC3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sertad3Q9ERC3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sertad3Q9ERC3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sertad3Q9ERC3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sertad3Q9ERC3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sertad3Q9ERC3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sertad3Q9ERC3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Sertad3Q9ERC3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sertad3Q9ERC3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sertad3Q9ERC3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Sertad3Q9ERC3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sertad3Q9ERC3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sertad3Q9ERC3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sertad3Q9ERC3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sertad3Q9ERC3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sertad3Q9ERC3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sertad3Q9ERC3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sertad3Q9ERC3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sertad3Q9ERC3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sertad3Q9ERC3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sertad3Q9ERC3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sertad3Q9ERC3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sertad3Q9ERC3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sertad3Q9ERC3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sertad3Q9ERC3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sertad3Q9ERC3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sertad3Q9ERC3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sertad3Q9ERC3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sertad3Q9ERC3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sertad3Q9ERC3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sertad3Q9ERC3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sertad3Q9ERC3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sertad3Q9ERC3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sertad3Q9ERC3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sertad3Q9ERC3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Sertad3Q9ERC3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sertad3Q9ERC3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sertad3Q9ERC3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sertad3Q9ERC3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sertad3Q9ERC3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sertad3Q9ERC3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Sertad3Q9ERC3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sertad3Q9ERC3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sertad3Q9ERC3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sertad3Q9ERC3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sertad3Q9ERC3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sertad3Q9ERC3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sertad3Q9ERC3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sertad3Q9ERC3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sertad3Q9ERC3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sertad3Q9ERC3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sertad3Q9ERC3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sertad3Q9ERC3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sertad3Q9ERC3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sertad3Q9ERC3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sertad3Q9ERC3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sertad3Q9ERC3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sertad3Q9ERC3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sertad3Q9ERC3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sertad3Q9ERC3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sertad3Q9ERC3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sertad3Q9ERC3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sertad3Q9ERC3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sertad3Q9ERC3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sertad3Q9ERC3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sertad3Q9ERC3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sertad3Q9ERC3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sertad3Q9ERC3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sertad3Q9ERC3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Sertad3Q9ERC3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sertad3Q9ERC3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sertad3Q9ERC3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sertad3Q9ERC3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sertad3Q9ERC3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sertad3Q9ERC3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sertad3Q9ERC3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sertad3Q9ERC3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sertad3Q9ERC3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sertad3Q9ERC3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sertad3Q9ERC3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sertad3Q9ERC3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sertad3Q9ERC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sertad3Q9ERC3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sertad3Q9ERC3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sertad3Q9ERC3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sertad3Q9ERC3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sertad3Q9ERC3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sertad3Q9ERC3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sertad3Q9ERC3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sertad3Q9ERC3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sertad3Q9ERC3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sertad3Q9ERC3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sertad3Q9ERC3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sertad3Q9ERC3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sertad3Q9ERC3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sertad3Q9ERC3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sertad3Q9ERC3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sertad3Q9ERC3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 299.5 ms