Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36,2■■■■□ 3,39
Irx6Q9ER75 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Irx6Q9ER75 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Irx6Q9ER75 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Irx6Q9ER75 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Irx6Q9ER75 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Irx6Q9ER75 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Irx6Q9ER75 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Irx6Q9ER75 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,87■■■■□ 3,33
Irx6Q9ER75 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Irx6Q9ER75 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Irx6Q9ER75 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Irx6Q9ER75 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Irx6Q9ER75 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Irx6Q9ER75 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35,69■■■■□ 3,3
Irx6Q9ER75 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Irx6Q9ER75 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Irx6Q9ER75 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Irx6Q9ER75 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Irx6Q9ER75 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Irx6Q9ER75 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Irx6Q9ER75 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Irx6Q9ER75 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Irx6Q9ER75 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Irx6Q9ER75 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Irx6Q9ER75 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Irx6Q9ER75 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35,34■■■■□ 3,25
Irx6Q9ER75 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Irx6Q9ER75 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Irx6Q9ER75 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Irx6Q9ER75 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Irx6Q9ER75 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,27■■■■□ 3,24
Irx6Q9ER75 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Irx6Q9ER75 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Irx6Q9ER75 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Irx6Q9ER75 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Irx6Q9ER75 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Irx6Q9ER75 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Irx6Q9ER75 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Irx6Q9ER75 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Irx6Q9ER75 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Irx6Q9ER75 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35,06■■■■□ 3,2
Irx6Q9ER75 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Irx6Q9ER75 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Irx6Q9ER75 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Irx6Q9ER75 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Irx6Q9ER75 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Irx6Q9ER75 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35,01■■■■□ 3,19
Irx6Q9ER75 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Irx6Q9ER75 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Irx6Q9ER75 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,94■■■■□ 3,18
Irx6Q9ER75 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Irx6Q9ER75 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,87■■■■□ 3,17
Irx6Q9ER75 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Irx6Q9ER75 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Irx6Q9ER75 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Irx6Q9ER75 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,79■■■■□ 3,16
Irx6Q9ER75 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Irx6Q9ER75 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Irx6Q9ER75 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Irx6Q9ER75 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Irx6Q9ER75 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Irx6Q9ER75 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Irx6Q9ER75 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Irx6Q9ER75 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Irx6Q9ER75 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Irx6Q9ER75 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Irx6Q9ER75 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Irx6Q9ER75 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Irx6Q9ER75 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,53■■■■□ 3,12
Irx6Q9ER75 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,51■■■■□ 3,12
Irx6Q9ER75 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Irx6Q9ER75 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Irx6Q9ER75 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,37■■■■□ 3,09
Irx6Q9ER75 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Irx6Q9ER75 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Irx6Q9ER75 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Irx6Q9ER75 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Irx6Q9ER75 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34,26■■■■□ 3,08
Irx6Q9ER75 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,26■■■■□ 3,08
Irx6Q9ER75 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Irx6Q9ER75 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Irx6Q9ER75 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Irx6Q9ER75 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Irx6Q9ER75 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Irx6Q9ER75 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Irx6Q9ER75 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Irx6Q9ER75 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,15■■■■□ 3,06
Irx6Q9ER75 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,14■■■■□ 3,06
Irx6Q9ER75 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Irx6Q9ER75 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
Irx6Q9ER75 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Irx6Q9ER75 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Irx6Q9ER75 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
Irx6Q9ER75 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Irx6Q9ER75 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Irx6Q9ER75 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Irx6Q9ER75 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Irx6Q9ER75 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Irx6Q9ER75 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms