Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC7

Isoc2b, Isochorismatase domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isoc2bQ9DCC7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Isoc2bQ9DCC7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Isoc2bQ9DCC7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Isoc2bQ9DCC7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Isoc2bQ9DCC7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Isoc2bQ9DCC7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Isoc2bQ9DCC7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Isoc2bQ9DCC7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Isoc2bQ9DCC7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Isoc2bQ9DCC7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Isoc2bQ9DCC7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Isoc2bQ9DCC7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Isoc2bQ9DCC7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Isoc2bQ9DCC7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Isoc2bQ9DCC7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Isoc2bQ9DCC7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Isoc2bQ9DCC7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Isoc2bQ9DCC7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Isoc2bQ9DCC7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Isoc2bQ9DCC7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Isoc2bQ9DCC7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Isoc2bQ9DCC7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Isoc2bQ9DCC7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Isoc2bQ9DCC7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Isoc2bQ9DCC7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Isoc2bQ9DCC7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Isoc2bQ9DCC7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Isoc2bQ9DCC7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Isoc2bQ9DCC7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Isoc2bQ9DCC7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Isoc2bQ9DCC7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Isoc2bQ9DCC7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Isoc2bQ9DCC7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Isoc2bQ9DCC7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Isoc2bQ9DCC7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Isoc2bQ9DCC7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Isoc2bQ9DCC7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Isoc2bQ9DCC7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Isoc2bQ9DCC7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Isoc2bQ9DCC7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Isoc2bQ9DCC7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Isoc2bQ9DCC7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Isoc2bQ9DCC7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Isoc2bQ9DCC7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Isoc2bQ9DCC7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Isoc2bQ9DCC7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Isoc2bQ9DCC7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Isoc2bQ9DCC7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Isoc2bQ9DCC7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Isoc2bQ9DCC7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Isoc2bQ9DCC7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Isoc2bQ9DCC7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Isoc2bQ9DCC7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Isoc2bQ9DCC7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Isoc2bQ9DCC7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Isoc2bQ9DCC7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Isoc2bQ9DCC7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Isoc2bQ9DCC7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Isoc2bQ9DCC7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Isoc2bQ9DCC7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Isoc2bQ9DCC7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Isoc2bQ9DCC7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Isoc2bQ9DCC7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Isoc2bQ9DCC7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Isoc2bQ9DCC7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Isoc2bQ9DCC7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Isoc2bQ9DCC7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Isoc2bQ9DCC7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Isoc2bQ9DCC7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Isoc2bQ9DCC7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Isoc2bQ9DCC7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Isoc2bQ9DCC7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Isoc2bQ9DCC7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Isoc2bQ9DCC7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Isoc2bQ9DCC7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Isoc2bQ9DCC7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Isoc2bQ9DCC7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Isoc2bQ9DCC7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Isoc2bQ9DCC7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Isoc2bQ9DCC7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Isoc2bQ9DCC7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Isoc2bQ9DCC7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Isoc2bQ9DCC7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Isoc2bQ9DCC7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Isoc2bQ9DCC7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Isoc2bQ9DCC7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Isoc2bQ9DCC7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Isoc2bQ9DCC7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Isoc2bQ9DCC7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Isoc2bQ9DCC7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Isoc2bQ9DCC7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Isoc2bQ9DCC7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Isoc2bQ9DCC7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Isoc2bQ9DCC7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Isoc2bQ9DCC7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Isoc2bQ9DCC7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Isoc2bQ9DCC7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Isoc2bQ9DCC7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Isoc2bQ9DCC7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Isoc2bQ9DCC7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms