Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap1s2Q9DB50 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap1s2Q9DB50 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap1s2Q9DB50 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap1s2Q9DB50 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap1s2Q9DB50 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap1s2Q9DB50 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap1s2Q9DB50 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap1s2Q9DB50 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap1s2Q9DB50 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ap1s2Q9DB50 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap1s2Q9DB50 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap1s2Q9DB50 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap1s2Q9DB50 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap1s2Q9DB50 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap1s2Q9DB50 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap1s2Q9DB50 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ap1s2Q9DB50 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ap1s2Q9DB50 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap1s2Q9DB50 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap1s2Q9DB50 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1s2Q9DB50 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap1s2Q9DB50 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1s2Q9DB50 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1s2Q9DB50 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1s2Q9DB50 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1s2Q9DB50 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1s2Q9DB50 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1s2Q9DB50 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1s2Q9DB50 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1s2Q9DB50 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap1s2Q9DB50 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1s2Q9DB50 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1s2Q9DB50 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap1s2Q9DB50 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap1s2Q9DB50 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap1s2Q9DB50 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap1s2Q9DB50 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap1s2Q9DB50 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap1s2Q9DB50 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap1s2Q9DB50 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap1s2Q9DB50 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap1s2Q9DB50 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap1s2Q9DB50 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap1s2Q9DB50 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap1s2Q9DB50 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap1s2Q9DB50 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap1s2Q9DB50 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap1s2Q9DB50 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap1s2Q9DB50 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap1s2Q9DB50 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s2Q9DB50 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap1s2Q9DB50 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap1s2Q9DB50 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap1s2Q9DB50 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap1s2Q9DB50 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap1s2Q9DB50 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap1s2Q9DB50 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap1s2Q9DB50 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap1s2Q9DB50 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap1s2Q9DB50 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap1s2Q9DB50 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap1s2Q9DB50 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap1s2Q9DB50 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap1s2Q9DB50 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap1s2Q9DB50 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap1s2Q9DB50 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap1s2Q9DB50 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap1s2Q9DB50 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap1s2Q9DB50 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap1s2Q9DB50 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap1s2Q9DB50 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap1s2Q9DB50 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap1s2Q9DB50 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap1s2Q9DB50 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1s2Q9DB50 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1s2Q9DB50 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1s2Q9DB50 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1s2Q9DB50 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1s2Q9DB50 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1s2Q9DB50 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s2Q9DB50 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1s2Q9DB50 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s2Q9DB50 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s2Q9DB50 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1s2Q9DB50 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1s2Q9DB50 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1s2Q9DB50 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms