Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Cmtm2aQ9DAR1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Cmtm2aQ9DAR1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Cmtm2aQ9DAR1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Cmtm2aQ9DAR1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Cmtm2aQ9DAR1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Cmtm2aQ9DAR1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Cmtm2aQ9DAR1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Cmtm2aQ9DAR1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Cmtm2aQ9DAR1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Cmtm2aQ9DAR1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,65■■□□□ 1,38
Cmtm2aQ9DAR1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Cmtm2aQ9DAR1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Cmtm2aQ9DAR1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Cmtm2aQ9DAR1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Cmtm2aQ9DAR1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Cmtm2aQ9DAR1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Cmtm2aQ9DAR1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Cmtm2aQ9DAR1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Cmtm2aQ9DAR1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Cmtm2aQ9DAR1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Cmtm2aQ9DAR1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Cmtm2aQ9DAR1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Cmtm2aQ9DAR1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Cmtm2aQ9DAR1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Cmtm2aQ9DAR1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Cmtm2aQ9DAR1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Cmtm2aQ9DAR1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Cmtm2aQ9DAR1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Cmtm2aQ9DAR1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Cmtm2aQ9DAR1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Cmtm2aQ9DAR1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Cmtm2aQ9DAR1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Cmtm2aQ9DAR1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Cmtm2aQ9DAR1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Cmtm2aQ9DAR1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Cmtm2aQ9DAR1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
Cmtm2aQ9DAR1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Cmtm2aQ9DAR1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Cmtm2aQ9DAR1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Cmtm2aQ9DAR1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Cmtm2aQ9DAR1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Cmtm2aQ9DAR1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Cmtm2aQ9DAR1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Cmtm2aQ9DAR1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Cmtm2aQ9DAR1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Cmtm2aQ9DAR1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Cmtm2aQ9DAR1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Cmtm2aQ9DAR1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Cmtm2aQ9DAR1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
Cmtm2aQ9DAR1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Cmtm2aQ9DAR1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Cmtm2aQ9DAR1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,08■■□□□ 1,29
Cmtm2aQ9DAR1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Cmtm2aQ9DAR1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Cmtm2aQ9DAR1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Cmtm2aQ9DAR1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Cmtm2aQ9DAR1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,01■■□□□ 1,27
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Cmtm2aQ9DAR1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Cmtm2aQ9DAR1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Cmtm2aQ9DAR1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Cmtm2aQ9DAR1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Cmtm2aQ9DAR1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Cmtm2aQ9DAR1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Cmtm2aQ9DAR1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Cmtm2aQ9DAR1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Cmtm2aQ9DAR1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Cmtm2aQ9DAR1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Cmtm2aQ9DAR1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Cmtm2aQ9DAR1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Cmtm2aQ9DAR1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Cmtm2aQ9DAR1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Cmtm2aQ9DAR1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Cmtm2aQ9DAR1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Cmtm2aQ9DAR1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Cmtm2aQ9DAR1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Cmtm2aQ9DAR1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Cmtm2aQ9DAR1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Cmtm2aQ9DAR1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Cmtm2aQ9DAR1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Cmtm2aQ9DAR1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Cmtm2aQ9DAR1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Cmtm2aQ9DAR1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Cmtm2aQ9DAR1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Cmtm2aQ9DAR1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,73■■□□□ 1,23
Cmtm2aQ9DAR1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Cmtm2aQ9DAR1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Cmtm2aQ9DAR1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Cmtm2aQ9DAR1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms