Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Calr3Q9D9Q6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Calr3Q9D9Q6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Calr3Q9D9Q6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Calr3Q9D9Q6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Calr3Q9D9Q6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Calr3Q9D9Q6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Calr3Q9D9Q6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Calr3Q9D9Q6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Calr3Q9D9Q6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Calr3Q9D9Q6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Calr3Q9D9Q6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Calr3Q9D9Q6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Calr3Q9D9Q6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Calr3Q9D9Q6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Calr3Q9D9Q6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Calr3Q9D9Q6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Calr3Q9D9Q6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Calr3Q9D9Q6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Calr3Q9D9Q6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Calr3Q9D9Q6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Calr3Q9D9Q6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Calr3Q9D9Q6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Calr3Q9D9Q6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Calr3Q9D9Q6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Calr3Q9D9Q6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Calr3Q9D9Q6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Calr3Q9D9Q6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Calr3Q9D9Q6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Calr3Q9D9Q6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Calr3Q9D9Q6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Calr3Q9D9Q6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Calr3Q9D9Q6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Calr3Q9D9Q6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Calr3Q9D9Q6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Calr3Q9D9Q6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Calr3Q9D9Q6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Calr3Q9D9Q6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Calr3Q9D9Q6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Calr3Q9D9Q6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Calr3Q9D9Q6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Calr3Q9D9Q6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Calr3Q9D9Q6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Calr3Q9D9Q6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Calr3Q9D9Q6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Calr3Q9D9Q6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Calr3Q9D9Q6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Calr3Q9D9Q6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Calr3Q9D9Q6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Calr3Q9D9Q6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Calr3Q9D9Q6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Calr3Q9D9Q6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Calr3Q9D9Q6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Calr3Q9D9Q6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Calr3Q9D9Q6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Calr3Q9D9Q6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Calr3Q9D9Q6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Calr3Q9D9Q6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Calr3Q9D9Q6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Calr3Q9D9Q6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Calr3Q9D9Q6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Calr3Q9D9Q6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Calr3Q9D9Q6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Calr3Q9D9Q6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Calr3Q9D9Q6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Calr3Q9D9Q6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Calr3Q9D9Q6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Calr3Q9D9Q6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Calr3Q9D9Q6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Calr3Q9D9Q6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Calr3Q9D9Q6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Calr3Q9D9Q6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Calr3Q9D9Q6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Calr3Q9D9Q6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Calr3Q9D9Q6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Calr3Q9D9Q6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Calr3Q9D9Q6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Calr3Q9D9Q6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Calr3Q9D9Q6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Calr3Q9D9Q6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Calr3Q9D9Q6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Calr3Q9D9Q6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Calr3Q9D9Q6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Calr3Q9D9Q6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Calr3Q9D9Q6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Calr3Q9D9Q6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Calr3Q9D9Q6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Calr3Q9D9Q6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Calr3Q9D9Q6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Calr3Q9D9Q6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Calr3Q9D9Q6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Calr3Q9D9Q6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Calr3Q9D9Q6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Calr3Q9D9Q6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Calr3Q9D9Q6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Calr3Q9D9Q6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Calr3Q9D9Q6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Calr3Q9D9Q6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Calr3Q9D9Q6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Calr3Q9D9Q6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms