Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pdzd9Q9D9M4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Pdzd9Q9D9M4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Pdzd9Q9D9M4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pdzd9Q9D9M4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pdzd9Q9D9M4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pdzd9Q9D9M4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pdzd9Q9D9M4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pdzd9Q9D9M4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pdzd9Q9D9M4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pdzd9Q9D9M4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Pdzd9Q9D9M4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pdzd9Q9D9M4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Pdzd9Q9D9M4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pdzd9Q9D9M4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Pdzd9Q9D9M4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Pdzd9Q9D9M4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pdzd9Q9D9M4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pdzd9Q9D9M4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Pdzd9Q9D9M4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Pdzd9Q9D9M4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pdzd9Q9D9M4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pdzd9Q9D9M4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pdzd9Q9D9M4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Pdzd9Q9D9M4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pdzd9Q9D9M4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pdzd9Q9D9M4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Pdzd9Q9D9M4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Pdzd9Q9D9M4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Pdzd9Q9D9M4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pdzd9Q9D9M4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pdzd9Q9D9M4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pdzd9Q9D9M4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pdzd9Q9D9M4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pdzd9Q9D9M4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pdzd9Q9D9M4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Pdzd9Q9D9M4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pdzd9Q9D9M4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Pdzd9Q9D9M4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pdzd9Q9D9M4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Pdzd9Q9D9M4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pdzd9Q9D9M4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Pdzd9Q9D9M4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pdzd9Q9D9M4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pdzd9Q9D9M4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pdzd9Q9D9M4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pdzd9Q9D9M4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pdzd9Q9D9M4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pdzd9Q9D9M4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pdzd9Q9D9M4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pdzd9Q9D9M4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pdzd9Q9D9M4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pdzd9Q9D9M4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pdzd9Q9D9M4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Pdzd9Q9D9M4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pdzd9Q9D9M4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pdzd9Q9D9M4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pdzd9Q9D9M4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pdzd9Q9D9M4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pdzd9Q9D9M4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pdzd9Q9D9M4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pdzd9Q9D9M4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Pdzd9Q9D9M4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pdzd9Q9D9M4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Pdzd9Q9D9M4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pdzd9Q9D9M4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pdzd9Q9D9M4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pdzd9Q9D9M4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pdzd9Q9D9M4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Pdzd9Q9D9M4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Pdzd9Q9D9M4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pdzd9Q9D9M4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pdzd9Q9D9M4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Pdzd9Q9D9M4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Pdzd9Q9D9M4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pdzd9Q9D9M4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pdzd9Q9D9M4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pdzd9Q9D9M4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pdzd9Q9D9M4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pdzd9Q9D9M4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pdzd9Q9D9M4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pdzd9Q9D9M4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pdzd9Q9D9M4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pdzd9Q9D9M4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Pdzd9Q9D9M4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pdzd9Q9D9M4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pdzd9Q9D9M4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pdzd9Q9D9M4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Pdzd9Q9D9M4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
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