Protein–RNA interactions for Protein: Q9D994

Wdr38, WD repeat-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr38Q9D994 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Wdr38Q9D994 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Wdr38Q9D994 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Wdr38Q9D994 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Wdr38Q9D994 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Wdr38Q9D994 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Wdr38Q9D994 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18,18■□□□□ 0,5
Wdr38Q9D994 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Wdr38Q9D994 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,17■□□□□ 0,5
Wdr38Q9D994 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Wdr38Q9D994 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Wdr38Q9D994 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Wdr38Q9D994 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18,15■□□□□ 0,5
Wdr38Q9D994 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Wdr38Q9D994 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Wdr38Q9D994 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18,11■□□□□ 0,49
Wdr38Q9D994 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Wdr38Q9D994 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,1■□□□□ 0,49
Wdr38Q9D994 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Wdr38Q9D994 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Wdr38Q9D994 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Wdr38Q9D994 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Wdr38Q9D994 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Wdr38Q9D994 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Wdr38Q9D994 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Wdr38Q9D994 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17,98■□□□□ 0,47
Wdr38Q9D994 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Wdr38Q9D994 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Wdr38Q9D994 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Wdr38Q9D994 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Wdr38Q9D994 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Wdr38Q9D994 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Wdr38Q9D994 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Wdr38Q9D994 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Wdr38Q9D994 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Wdr38Q9D994 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17,87■□□□□ 0,45
Wdr38Q9D994 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Wdr38Q9D994 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Wdr38Q9D994 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Wdr38Q9D994 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Wdr38Q9D994 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Wdr38Q9D994 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17,8■□□□□ 0,44
Wdr38Q9D994 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Wdr38Q9D994 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,79■□□□□ 0,44
Wdr38Q9D994 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17,78■□□□□ 0,44
Wdr38Q9D994 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
Wdr38Q9D994 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,76■□□□□ 0,43
Wdr38Q9D994 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17,76■□□□□ 0,43
Wdr38Q9D994 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17,75■□□□□ 0,43
Wdr38Q9D994 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17,74■□□□□ 0,43
Wdr38Q9D994 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Wdr38Q9D994 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Wdr38Q9D994 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Wdr38Q9D994 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Wdr38Q9D994 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Wdr38Q9D994 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17,68■□□□□ 0,42
Wdr38Q9D994 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Wdr38Q9D994 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17,65■□□□□ 0,42
Wdr38Q9D994 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,62■□□□□ 0,41
Wdr38Q9D994 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Wdr38Q9D994 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Wdr38Q9D994 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,6■□□□□ 0,41
Wdr38Q9D994 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17,6■□□□□ 0,41
Wdr38Q9D994 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Wdr38Q9D994 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17,58■□□□□ 0,41
Wdr38Q9D994 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17,58■□□□□ 0,41
Wdr38Q9D994 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,41
Wdr38Q9D994 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,4
Wdr38Q9D994 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Wdr38Q9D994 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Wdr38Q9D994 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Wdr38Q9D994 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,54■□□□□ 0,4
Wdr38Q9D994 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Wdr38Q9D994 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Wdr38Q9D994 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Wdr38Q9D994 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,39
Wdr38Q9D994 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Wdr38Q9D994 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Wdr38Q9D994 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17,5■□□□□ 0,39
Wdr38Q9D994 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Wdr38Q9D994 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17,49■□□□□ 0,39
Wdr38Q9D994 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,48■□□□□ 0,39
Wdr38Q9D994 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Wdr38Q9D994 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Wdr38Q9D994 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Wdr38Q9D994 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Wdr38Q9D994 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Wdr38Q9D994 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Wdr38Q9D994 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Wdr38Q9D994 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Wdr38Q9D994 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Wdr38Q9D994 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Wdr38Q9D994 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Wdr38Q9D994 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Wdr38Q9D994 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Wdr38Q9D994 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Wdr38Q9D994 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,41■□□□□ 0,38
Wdr38Q9D994 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Wdr38Q9D994 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Wdr38Q9D994 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17,37■□□□□ 0,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,1 ms