Protein–RNA interactions for Protein: Q9D848

AY761184, CRS1C-3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761184Q9D848 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AY761184Q9D848 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AY761184Q9D848 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AY761184Q9D848 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AY761184Q9D848 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AY761184Q9D848 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AY761184Q9D848 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AY761184Q9D848 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AY761184Q9D848 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AY761184Q9D848 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AY761184Q9D848 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AY761184Q9D848 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AY761184Q9D848 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AY761184Q9D848 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AY761184Q9D848 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AY761184Q9D848 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AY761184Q9D848 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AY761184Q9D848 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AY761184Q9D848 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AY761184Q9D848 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AY761184Q9D848 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AY761184Q9D848 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AY761184Q9D848 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AY761184Q9D848 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AY761184Q9D848 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AY761184Q9D848 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AY761184Q9D848 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AY761184Q9D848 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AY761184Q9D848 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AY761184Q9D848 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AY761184Q9D848 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AY761184Q9D848 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AY761184Q9D848 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AY761184Q9D848 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AY761184Q9D848 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AY761184Q9D848 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AY761184Q9D848 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AY761184Q9D848 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AY761184Q9D848 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AY761184Q9D848 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AY761184Q9D848 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AY761184Q9D848 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AY761184Q9D848 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AY761184Q9D848 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AY761184Q9D848 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AY761184Q9D848 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AY761184Q9D848 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AY761184Q9D848 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AY761184Q9D848 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AY761184Q9D848 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AY761184Q9D848 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AY761184Q9D848 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AY761184Q9D848 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AY761184Q9D848 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AY761184Q9D848 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AY761184Q9D848 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AY761184Q9D848 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AY761184Q9D848 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AY761184Q9D848 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AY761184Q9D848 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AY761184Q9D848 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AY761184Q9D848 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AY761184Q9D848 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AY761184Q9D848 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AY761184Q9D848 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AY761184Q9D848 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AY761184Q9D848 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AY761184Q9D848 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AY761184Q9D848 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AY761184Q9D848 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AY761184Q9D848 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AY761184Q9D848 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AY761184Q9D848 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AY761184Q9D848 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AY761184Q9D848 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AY761184Q9D848 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AY761184Q9D848 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AY761184Q9D848 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AY761184Q9D848 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AY761184Q9D848 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AY761184Q9D848 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AY761184Q9D848 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AY761184Q9D848 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AY761184Q9D848 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AY761184Q9D848 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AY761184Q9D848 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AY761184Q9D848 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AY761184Q9D848 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AY761184Q9D848 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AY761184Q9D848 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AY761184Q9D848 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AY761184Q9D848 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AY761184Q9D848 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AY761184Q9D848 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AY761184Q9D848 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AY761184Q9D848 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AY761184Q9D848 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AY761184Q9D848 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AY761184Q9D848 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AY761184Q9D848 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms