Protein–RNA interactions for Protein: Q9D809

2200002D01Rik, MCG22941, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2200002D01RikQ9D809 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
2200002D01RikQ9D809 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
2200002D01RikQ9D809 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
2200002D01RikQ9D809 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
2200002D01RikQ9D809 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
2200002D01RikQ9D809 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
2200002D01RikQ9D809 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
2200002D01RikQ9D809 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
2200002D01RikQ9D809 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
2200002D01RikQ9D809 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
2200002D01RikQ9D809 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
2200002D01RikQ9D809 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
2200002D01RikQ9D809 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
2200002D01RikQ9D809 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
2200002D01RikQ9D809 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,65■■□□□ 1,54
2200002D01RikQ9D809 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
2200002D01RikQ9D809 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
2200002D01RikQ9D809 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
2200002D01RikQ9D809 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,57■■□□□ 1,52
2200002D01RikQ9D809 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
2200002D01RikQ9D809 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
2200002D01RikQ9D809 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
2200002D01RikQ9D809 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,51■■□□□ 1,51
2200002D01RikQ9D809 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
2200002D01RikQ9D809 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
2200002D01RikQ9D809 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
2200002D01RikQ9D809 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
2200002D01RikQ9D809 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
2200002D01RikQ9D809 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
2200002D01RikQ9D809 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,32■■□□□ 1,48
2200002D01RikQ9D809 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
2200002D01RikQ9D809 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
2200002D01RikQ9D809 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
2200002D01RikQ9D809 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
2200002D01RikQ9D809 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
2200002D01RikQ9D809 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
2200002D01RikQ9D809 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
2200002D01RikQ9D809 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
2200002D01RikQ9D809 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
2200002D01RikQ9D809 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
2200002D01RikQ9D809 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,21■■□□□ 1,47
2200002D01RikQ9D809 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
2200002D01RikQ9D809 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
2200002D01RikQ9D809 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
2200002D01RikQ9D809 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
2200002D01RikQ9D809 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
2200002D01RikQ9D809 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
2200002D01RikQ9D809 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,13■■□□□ 1,45
2200002D01RikQ9D809 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,12■■□□□ 1,45
2200002D01RikQ9D809 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
2200002D01RikQ9D809 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
2200002D01RikQ9D809 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
2200002D01RikQ9D809 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,07■■□□□ 1,44
2200002D01RikQ9D809 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
2200002D01RikQ9D809 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
2200002D01RikQ9D809 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
2200002D01RikQ9D809 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
2200002D01RikQ9D809 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
2200002D01RikQ9D809 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
2200002D01RikQ9D809 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
2200002D01RikQ9D809 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
2200002D01RikQ9D809 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
2200002D01RikQ9D809 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
2200002D01RikQ9D809 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,43
2200002D01RikQ9D809 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
2200002D01RikQ9D809 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
2200002D01RikQ9D809 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
2200002D01RikQ9D809 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
2200002D01RikQ9D809 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,41
2200002D01RikQ9D809 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
2200002D01RikQ9D809 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
2200002D01RikQ9D809 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
2200002D01RikQ9D809 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
2200002D01RikQ9D809 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
2200002D01RikQ9D809 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
2200002D01RikQ9D809 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
2200002D01RikQ9D809 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
2200002D01RikQ9D809 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
2200002D01RikQ9D809 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
2200002D01RikQ9D809 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
2200002D01RikQ9D809 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,78■■□□□ 1,4
2200002D01RikQ9D809 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
2200002D01RikQ9D809 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
2200002D01RikQ9D809 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
2200002D01RikQ9D809 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
2200002D01RikQ9D809 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
2200002D01RikQ9D809 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,74■■□□□ 1,39
2200002D01RikQ9D809 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
2200002D01RikQ9D809 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
2200002D01RikQ9D809 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
2200002D01RikQ9D809 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
2200002D01RikQ9D809 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
2200002D01RikQ9D809 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
2200002D01RikQ9D809 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
2200002D01RikQ9D809 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,65■■□□□ 1,38
2200002D01RikQ9D809 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
2200002D01RikQ9D809 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
2200002D01RikQ9D809 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
2200002D01RikQ9D809 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
2200002D01RikQ9D809 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms