Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vstm5Q9D806 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vstm5Q9D806 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vstm5Q9D806 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vstm5Q9D806 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vstm5Q9D806 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vstm5Q9D806 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vstm5Q9D806 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vstm5Q9D806 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vstm5Q9D806 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vstm5Q9D806 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vstm5Q9D806 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vstm5Q9D806 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vstm5Q9D806 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vstm5Q9D806 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vstm5Q9D806 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vstm5Q9D806 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vstm5Q9D806 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vstm5Q9D806 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vstm5Q9D806 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vstm5Q9D806 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vstm5Q9D806 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vstm5Q9D806 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vstm5Q9D806 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vstm5Q9D806 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vstm5Q9D806 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vstm5Q9D806 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vstm5Q9D806 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vstm5Q9D806 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vstm5Q9D806 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vstm5Q9D806 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vstm5Q9D806 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vstm5Q9D806 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vstm5Q9D806 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vstm5Q9D806 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vstm5Q9D806 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vstm5Q9D806 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vstm5Q9D806 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vstm5Q9D806 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vstm5Q9D806 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vstm5Q9D806 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vstm5Q9D806 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vstm5Q9D806 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vstm5Q9D806 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vstm5Q9D806 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vstm5Q9D806 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vstm5Q9D806 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vstm5Q9D806 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm5Q9D806 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm5Q9D806 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vstm5Q9D806 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vstm5Q9D806 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vstm5Q9D806 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vstm5Q9D806 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vstm5Q9D806 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vstm5Q9D806 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vstm5Q9D806 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vstm5Q9D806 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vstm5Q9D806 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vstm5Q9D806 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vstm5Q9D806 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vstm5Q9D806 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vstm5Q9D806 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vstm5Q9D806 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vstm5Q9D806 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vstm5Q9D806 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vstm5Q9D806 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vstm5Q9D806 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vstm5Q9D806 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vstm5Q9D806 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vstm5Q9D806 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vstm5Q9D806 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vstm5Q9D806 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vstm5Q9D806 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm5Q9D806 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm5Q9D806 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vstm5Q9D806 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vstm5Q9D806 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vstm5Q9D806 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vstm5Q9D806 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vstm5Q9D806 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vstm5Q9D806 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vstm5Q9D806 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm5Q9D806 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm5Q9D806 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm5Q9D806 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm5Q9D806 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm5Q9D806 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vstm5Q9D806 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vstm5Q9D806 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vstm5Q9D806 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vstm5Q9D806 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vstm5Q9D806 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vstm5Q9D806 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vstm5Q9D806 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vstm5Q9D806 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vstm5Q9D806 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vstm5Q9D806 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vstm5Q9D806 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vstm5Q9D806 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms