Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc94Q9D6J3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc94Q9D6J3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc94Q9D6J3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc94Q9D6J3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc94Q9D6J3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc94Q9D6J3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc94Q9D6J3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc94Q9D6J3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc94Q9D6J3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc94Q9D6J3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc94Q9D6J3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc94Q9D6J3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc94Q9D6J3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc94Q9D6J3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc94Q9D6J3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc94Q9D6J3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc94Q9D6J3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc94Q9D6J3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc94Q9D6J3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc94Q9D6J3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc94Q9D6J3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc94Q9D6J3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc94Q9D6J3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc94Q9D6J3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc94Q9D6J3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc94Q9D6J3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc94Q9D6J3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc94Q9D6J3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc94Q9D6J3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc94Q9D6J3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc94Q9D6J3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc94Q9D6J3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc94Q9D6J3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc94Q9D6J3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc94Q9D6J3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc94Q9D6J3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc94Q9D6J3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc94Q9D6J3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc94Q9D6J3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc94Q9D6J3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc94Q9D6J3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc94Q9D6J3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc94Q9D6J3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc94Q9D6J3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc94Q9D6J3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc94Q9D6J3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc94Q9D6J3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc94Q9D6J3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc94Q9D6J3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc94Q9D6J3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc94Q9D6J3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc94Q9D6J3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc94Q9D6J3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc94Q9D6J3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc94Q9D6J3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc94Q9D6J3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc94Q9D6J3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc94Q9D6J3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc94Q9D6J3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc94Q9D6J3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc94Q9D6J3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc94Q9D6J3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc94Q9D6J3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc94Q9D6J3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc94Q9D6J3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc94Q9D6J3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc94Q9D6J3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc94Q9D6J3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc94Q9D6J3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc94Q9D6J3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc94Q9D6J3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc94Q9D6J3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc94Q9D6J3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc94Q9D6J3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc94Q9D6J3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc94Q9D6J3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc94Q9D6J3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc94Q9D6J3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc94Q9D6J3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc94Q9D6J3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc94Q9D6J3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc94Q9D6J3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc94Q9D6J3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc94Q9D6J3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc94Q9D6J3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc94Q9D6J3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms