Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Ccdc94Q9D6J3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Ccdc94Q9D6J3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Ccdc94Q9D6J3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Ccdc94Q9D6J3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Ccdc94Q9D6J3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Ccdc94Q9D6J3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Ccdc94Q9D6J3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Ccdc94Q9D6J3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Ccdc94Q9D6J3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Ccdc94Q9D6J3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Ccdc94Q9D6J3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ccdc94Q9D6J3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ccdc94Q9D6J3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ccdc94Q9D6J3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ccdc94Q9D6J3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ccdc94Q9D6J3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ccdc94Q9D6J3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ccdc94Q9D6J3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ccdc94Q9D6J3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ccdc94Q9D6J3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ccdc94Q9D6J3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ccdc94Q9D6J3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ccdc94Q9D6J3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ccdc94Q9D6J3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ccdc94Q9D6J3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ccdc94Q9D6J3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ccdc94Q9D6J3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Ccdc94Q9D6J3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Ccdc94Q9D6J3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Ccdc94Q9D6J3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Ccdc94Q9D6J3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ccdc94Q9D6J3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ccdc94Q9D6J3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ccdc94Q9D6J3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Ccdc94Q9D6J3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ccdc94Q9D6J3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ccdc94Q9D6J3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Ccdc94Q9D6J3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Ccdc94Q9D6J3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Ccdc94Q9D6J3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Ccdc94Q9D6J3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Ccdc94Q9D6J3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Ccdc94Q9D6J3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ccdc94Q9D6J3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ccdc94Q9D6J3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Ccdc94Q9D6J3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ccdc94Q9D6J3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ccdc94Q9D6J3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ccdc94Q9D6J3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ccdc94Q9D6J3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ccdc94Q9D6J3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ccdc94Q9D6J3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ccdc94Q9D6J3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ccdc94Q9D6J3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Ccdc94Q9D6J3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ccdc94Q9D6J3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Ccdc94Q9D6J3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Ccdc94Q9D6J3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ccdc94Q9D6J3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ccdc94Q9D6J3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ccdc94Q9D6J3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ccdc94Q9D6J3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ccdc94Q9D6J3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ccdc94Q9D6J3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ccdc94Q9D6J3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ccdc94Q9D6J3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ccdc94Q9D6J3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ccdc94Q9D6J3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Ccdc94Q9D6J3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ccdc94Q9D6J3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ccdc94Q9D6J3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ccdc94Q9D6J3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ccdc94Q9D6J3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Ccdc94Q9D6J3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ccdc94Q9D6J3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ccdc94Q9D6J3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ccdc94Q9D6J3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Ccdc94Q9D6J3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Ccdc94Q9D6J3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Ccdc94Q9D6J3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Ccdc94Q9D6J3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ccdc94Q9D6J3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ccdc94Q9D6J3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ccdc94Q9D6J3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Ccdc94Q9D6J3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Ccdc94Q9D6J3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ccdc94Q9D6J3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ccdc94Q9D6J3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ccdc94Q9D6J3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ccdc94Q9D6J3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ccdc94Q9D6J3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Ccdc94Q9D6J3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,9 ms