Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tubb4aQ9D6F9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Tubb4aQ9D6F9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tubb4aQ9D6F9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Tubb4aQ9D6F9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tubb4aQ9D6F9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tubb4aQ9D6F9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tubb4aQ9D6F9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tubb4aQ9D6F9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tubb4aQ9D6F9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tubb4aQ9D6F9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tubb4aQ9D6F9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tubb4aQ9D6F9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tubb4aQ9D6F9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Tubb4aQ9D6F9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tubb4aQ9D6F9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tubb4aQ9D6F9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tubb4aQ9D6F9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tubb4aQ9D6F9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tubb4aQ9D6F9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Tubb4aQ9D6F9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tubb4aQ9D6F9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tubb4aQ9D6F9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tubb4aQ9D6F9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tubb4aQ9D6F9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tubb4aQ9D6F9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tubb4aQ9D6F9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tubb4aQ9D6F9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tubb4aQ9D6F9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tubb4aQ9D6F9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tubb4aQ9D6F9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubb4aQ9D6F9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubb4aQ9D6F9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tubb4aQ9D6F9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Tubb4aQ9D6F9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tubb4aQ9D6F9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tubb4aQ9D6F9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tubb4aQ9D6F9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tubb4aQ9D6F9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tubb4aQ9D6F9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tubb4aQ9D6F9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubb4aQ9D6F9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tubb4aQ9D6F9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tubb4aQ9D6F9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubb4aQ9D6F9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubb4aQ9D6F9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tubb4aQ9D6F9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubb4aQ9D6F9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubb4aQ9D6F9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Tubb4aQ9D6F9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tubb4aQ9D6F9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tubb4aQ9D6F9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tubb4aQ9D6F9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tubb4aQ9D6F9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tubb4aQ9D6F9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tubb4aQ9D6F9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tubb4aQ9D6F9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tubb4aQ9D6F9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tubb4aQ9D6F9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tubb4aQ9D6F9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Tubb4aQ9D6F9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tubb4aQ9D6F9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tubb4aQ9D6F9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tubb4aQ9D6F9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tubb4aQ9D6F9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tubb4aQ9D6F9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Tubb4aQ9D6F9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tubb4aQ9D6F9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubb4aQ9D6F9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubb4aQ9D6F9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubb4aQ9D6F9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tubb4aQ9D6F9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubb4aQ9D6F9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubb4aQ9D6F9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tubb4aQ9D6F9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tubb4aQ9D6F9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tubb4aQ9D6F9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tubb4aQ9D6F9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tubb4aQ9D6F9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tubb4aQ9D6F9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubb4aQ9D6F9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubb4aQ9D6F9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tubb4aQ9D6F9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubb4aQ9D6F9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubb4aQ9D6F9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubb4aQ9D6F9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tubb4aQ9D6F9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tubb4aQ9D6F9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tubb4aQ9D6F9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tubb4aQ9D6F9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tubb4aQ9D6F9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tubb4aQ9D6F9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tubb4aQ9D6F9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tubb4aQ9D6F9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms