Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Ribc2Q9D4Q1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ribc2Q9D4Q1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ribc2Q9D4Q1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ribc2Q9D4Q1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ribc2Q9D4Q1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ribc2Q9D4Q1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ribc2Q9D4Q1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Ribc2Q9D4Q1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Ribc2Q9D4Q1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ribc2Q9D4Q1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ribc2Q9D4Q1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ribc2Q9D4Q1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ribc2Q9D4Q1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ribc2Q9D4Q1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Ribc2Q9D4Q1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ribc2Q9D4Q1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ribc2Q9D4Q1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Ribc2Q9D4Q1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ribc2Q9D4Q1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ribc2Q9D4Q1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ribc2Q9D4Q1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ribc2Q9D4Q1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ribc2Q9D4Q1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ribc2Q9D4Q1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ribc2Q9D4Q1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Ribc2Q9D4Q1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ribc2Q9D4Q1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Ribc2Q9D4Q1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ribc2Q9D4Q1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ribc2Q9D4Q1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ribc2Q9D4Q1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ribc2Q9D4Q1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Ribc2Q9D4Q1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ribc2Q9D4Q1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ribc2Q9D4Q1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ribc2Q9D4Q1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Ribc2Q9D4Q1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ribc2Q9D4Q1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,13■■□□□ 1,61
Ribc2Q9D4Q1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ribc2Q9D4Q1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ribc2Q9D4Q1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ribc2Q9D4Q1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Ribc2Q9D4Q1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Ribc2Q9D4Q1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Ribc2Q9D4Q1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Ribc2Q9D4Q1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ribc2Q9D4Q1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ribc2Q9D4Q1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Ribc2Q9D4Q1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
Ribc2Q9D4Q1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ribc2Q9D4Q1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Ribc2Q9D4Q1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Ribc2Q9D4Q1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ribc2Q9D4Q1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ribc2Q9D4Q1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Ribc2Q9D4Q1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Ribc2Q9D4Q1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Ribc2Q9D4Q1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ribc2Q9D4Q1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Ribc2Q9D4Q1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Ribc2Q9D4Q1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Ribc2Q9D4Q1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Ribc2Q9D4Q1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ribc2Q9D4Q1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ribc2Q9D4Q1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ribc2Q9D4Q1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ribc2Q9D4Q1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ribc2Q9D4Q1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,7■■□□□ 1,55
Ribc2Q9D4Q1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ribc2Q9D4Q1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ribc2Q9D4Q1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ribc2Q9D4Q1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Ribc2Q9D4Q1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ribc2Q9D4Q1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ribc2Q9D4Q1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Ribc2Q9D4Q1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Ribc2Q9D4Q1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Ribc2Q9D4Q1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Ribc2Q9D4Q1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Ribc2Q9D4Q1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Ribc2Q9D4Q1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Ribc2Q9D4Q1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ribc2Q9D4Q1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Ribc2Q9D4Q1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ribc2Q9D4Q1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,56■■□□□ 1,52
Ribc2Q9D4Q1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ribc2Q9D4Q1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Ribc2Q9D4Q1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Ribc2Q9D4Q1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,52■■□□□ 1,52
Ribc2Q9D4Q1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Ribc2Q9D4Q1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Ribc2Q9D4Q1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Ribc2Q9D4Q1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Ribc2Q9D4Q1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Ribc2Q9D4Q1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Ribc2Q9D4Q1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Ribc2Q9D4Q1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Ribc2Q9D4Q1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms