Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Clvs1Q9D4C9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Clvs1Q9D4C9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Clvs1Q9D4C9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Clvs1Q9D4C9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Clvs1Q9D4C9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Clvs1Q9D4C9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Clvs1Q9D4C9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Clvs1Q9D4C9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Clvs1Q9D4C9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Clvs1Q9D4C9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Clvs1Q9D4C9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Clvs1Q9D4C9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Clvs1Q9D4C9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Clvs1Q9D4C9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Clvs1Q9D4C9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Clvs1Q9D4C9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Clvs1Q9D4C9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Clvs1Q9D4C9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Clvs1Q9D4C9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Clvs1Q9D4C9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Clvs1Q9D4C9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Clvs1Q9D4C9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Clvs1Q9D4C9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Clvs1Q9D4C9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Clvs1Q9D4C9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Clvs1Q9D4C9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Clvs1Q9D4C9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Clvs1Q9D4C9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Clvs1Q9D4C9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Clvs1Q9D4C9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Clvs1Q9D4C9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Clvs1Q9D4C9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Clvs1Q9D4C9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Clvs1Q9D4C9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Clvs1Q9D4C9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Clvs1Q9D4C9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Clvs1Q9D4C9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Clvs1Q9D4C9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Clvs1Q9D4C9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Clvs1Q9D4C9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Clvs1Q9D4C9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Clvs1Q9D4C9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Clvs1Q9D4C9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Clvs1Q9D4C9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,52■■□□□ 1,52
Clvs1Q9D4C9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Clvs1Q9D4C9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Clvs1Q9D4C9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Clvs1Q9D4C9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Clvs1Q9D4C9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Clvs1Q9D4C9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Clvs1Q9D4C9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Clvs1Q9D4C9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Clvs1Q9D4C9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Clvs1Q9D4C9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Clvs1Q9D4C9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Clvs1Q9D4C9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Clvs1Q9D4C9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Clvs1Q9D4C9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Clvs1Q9D4C9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Clvs1Q9D4C9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Clvs1Q9D4C9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Clvs1Q9D4C9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Clvs1Q9D4C9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Clvs1Q9D4C9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Clvs1Q9D4C9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Clvs1Q9D4C9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Clvs1Q9D4C9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Clvs1Q9D4C9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Clvs1Q9D4C9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Clvs1Q9D4C9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Clvs1Q9D4C9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Clvs1Q9D4C9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Clvs1Q9D4C9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Clvs1Q9D4C9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Clvs1Q9D4C9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Clvs1Q9D4C9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,2■■□□□ 1,46
Clvs1Q9D4C9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,19■■□□□ 1,46
Clvs1Q9D4C9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Clvs1Q9D4C9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Clvs1Q9D4C9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Clvs1Q9D4C9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Clvs1Q9D4C9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Clvs1Q9D4C9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Clvs1Q9D4C9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Clvs1Q9D4C9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Clvs1Q9D4C9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Clvs1Q9D4C9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Clvs1Q9D4C9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Clvs1Q9D4C9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Clvs1Q9D4C9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Clvs1Q9D4C9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Clvs1Q9D4C9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Clvs1Q9D4C9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Clvs1Q9D4C9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Clvs1Q9D4C9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Clvs1Q9D4C9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms