Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4933428M09RikQ9D3X3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4933428M09RikQ9D3X3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
4933428M09RikQ9D3X3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
4933428M09RikQ9D3X3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933428M09RikQ9D3X3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4933428M09RikQ9D3X3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
4933428M09RikQ9D3X3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4933428M09RikQ9D3X3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
4933428M09RikQ9D3X3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4933428M09RikQ9D3X3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4933428M09RikQ9D3X3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4933428M09RikQ9D3X3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
4933428M09RikQ9D3X3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4933428M09RikQ9D3X3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4933428M09RikQ9D3X3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4933428M09RikQ9D3X3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4933428M09RikQ9D3X3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4933428M09RikQ9D3X3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4933428M09RikQ9D3X3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
4933428M09RikQ9D3X3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4933428M09RikQ9D3X3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4933428M09RikQ9D3X3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4933428M09RikQ9D3X3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4933428M09RikQ9D3X3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4933428M09RikQ9D3X3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
4933428M09RikQ9D3X3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
4933428M09RikQ9D3X3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4933428M09RikQ9D3X3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4933428M09RikQ9D3X3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4933428M09RikQ9D3X3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
4933428M09RikQ9D3X3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
4933428M09RikQ9D3X3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4933428M09RikQ9D3X3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4933428M09RikQ9D3X3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4933428M09RikQ9D3X3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4933428M09RikQ9D3X3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
4933428M09RikQ9D3X3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
4933428M09RikQ9D3X3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4933428M09RikQ9D3X3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4933428M09RikQ9D3X3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4933428M09RikQ9D3X3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
4933428M09RikQ9D3X3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
4933428M09RikQ9D3X3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
4933428M09RikQ9D3X3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4933428M09RikQ9D3X3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4933428M09RikQ9D3X3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4933428M09RikQ9D3X3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4933428M09RikQ9D3X3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4933428M09RikQ9D3X3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
4933428M09RikQ9D3X3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4933428M09RikQ9D3X3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
4933428M09RikQ9D3X3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4933428M09RikQ9D3X3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
4933428M09RikQ9D3X3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4933428M09RikQ9D3X3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
4933428M09RikQ9D3X3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4933428M09RikQ9D3X3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4933428M09RikQ9D3X3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933428M09RikQ9D3X3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933428M09RikQ9D3X3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4933428M09RikQ9D3X3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
4933428M09RikQ9D3X3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933428M09RikQ9D3X3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933428M09RikQ9D3X3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933428M09RikQ9D3X3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933428M09RikQ9D3X3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933428M09RikQ9D3X3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933428M09RikQ9D3X3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933428M09RikQ9D3X3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933428M09RikQ9D3X3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933428M09RikQ9D3X3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933428M09RikQ9D3X3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933428M09RikQ9D3X3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933428M09RikQ9D3X3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933428M09RikQ9D3X3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933428M09RikQ9D3X3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933428M09RikQ9D3X3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
4933428M09RikQ9D3X3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4933428M09RikQ9D3X3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4933428M09RikQ9D3X3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4933428M09RikQ9D3X3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms