Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim42Q9D2H5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim42Q9D2H5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim42Q9D2H5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim42Q9D2H5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim42Q9D2H5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim42Q9D2H5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim42Q9D2H5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim42Q9D2H5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim42Q9D2H5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim42Q9D2H5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim42Q9D2H5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim42Q9D2H5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim42Q9D2H5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim42Q9D2H5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim42Q9D2H5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim42Q9D2H5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim42Q9D2H5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim42Q9D2H5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim42Q9D2H5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim42Q9D2H5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim42Q9D2H5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim42Q9D2H5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim42Q9D2H5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim42Q9D2H5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim42Q9D2H5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim42Q9D2H5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim42Q9D2H5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim42Q9D2H5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim42Q9D2H5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim42Q9D2H5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim42Q9D2H5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim42Q9D2H5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim42Q9D2H5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim42Q9D2H5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim42Q9D2H5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim42Q9D2H5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim42Q9D2H5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim42Q9D2H5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim42Q9D2H5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim42Q9D2H5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim42Q9D2H5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim42Q9D2H5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim42Q9D2H5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim42Q9D2H5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim42Q9D2H5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim42Q9D2H5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim42Q9D2H5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim42Q9D2H5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim42Q9D2H5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim42Q9D2H5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim42Q9D2H5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim42Q9D2H5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim42Q9D2H5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim42Q9D2H5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim42Q9D2H5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trim42Q9D2H5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim42Q9D2H5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim42Q9D2H5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim42Q9D2H5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim42Q9D2H5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim42Q9D2H5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim42Q9D2H5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim42Q9D2H5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim42Q9D2H5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim42Q9D2H5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim42Q9D2H5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim42Q9D2H5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim42Q9D2H5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim42Q9D2H5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim42Q9D2H5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim42Q9D2H5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim42Q9D2H5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim42Q9D2H5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim42Q9D2H5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim42Q9D2H5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim42Q9D2H5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim42Q9D2H5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim42Q9D2H5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim42Q9D2H5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim42Q9D2H5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim42Q9D2H5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim42Q9D2H5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim42Q9D2H5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim42Q9D2H5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim42Q9D2H5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim42Q9D2H5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim42Q9D2H5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim42Q9D2H5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim42Q9D2H5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim42Q9D2H5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim42Q9D2H5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim42Q9D2H5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim42Q9D2H5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim42Q9D2H5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim42Q9D2H5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim42Q9D2H5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim42Q9D2H5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim42Q9D2H5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim42Q9D2H5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms