Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2G5

Synj2, Synaptojanin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synj2Q9D2G5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
Synj2Q9D2G5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,71■■■■■ 4,43
Synj2Q9D2G5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,58■■■■■ 4,41
Synj2Q9D2G5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42,56■■■■■ 4,4
Synj2Q9D2G5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC42,54■■■■■ 4,4
Synj2Q9D2G5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42,51■■■■■ 4,4
Synj2Q9D2G5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
Synj2Q9D2G5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,44■■■■■ 4,39
Synj2Q9D2G5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,44■■■■■ 4,38
Synj2Q9D2G5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,41■■■■■ 4,38
Synj2Q9D2G5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC42,38■■■■■ 4,38
Synj2Q9D2G5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42,38■■■■■ 4,38
Synj2Q9D2G5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
Synj2Q9D2G5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
Synj2Q9D2G5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,32■■■■■ 4,37
Synj2Q9D2G5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42,29■■■■■ 4,36
Synj2Q9D2G5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC42,24■■■■■ 4,35
Synj2Q9D2G5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC42,23■■■■■ 4,35
Synj2Q9D2G5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
Synj2Q9D2G5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42,15■■■■■ 4,34
Synj2Q9D2G5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,15■■■■■ 4,34
Synj2Q9D2G5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,14■■■■■ 4,34
Synj2Q9D2G5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,13■■■■■ 4,33
Synj2Q9D2G5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC42,12■■■■■ 4,33
Synj2Q9D2G5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC42,1■■■■■ 4,33
Synj2Q9D2G5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,07■■■■■ 4,33
Synj2Q9D2G5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC42,04■■■■■ 4,32
Synj2Q9D2G5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42,02■■■■■ 4,32
Synj2Q9D2G5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC41,97■■■■■ 4,31
Synj2Q9D2G5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,96■■■■■ 4,31
Synj2Q9D2G5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,94■■■■■ 4,3
Synj2Q9D2G5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC41,93■■■■■ 4,3
Synj2Q9D2G5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,85■■■■■ 4,29
Synj2Q9D2G5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41,84■■■■■ 4,29
Synj2Q9D2G5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41,81■■■■■ 4,28
Synj2Q9D2G5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
Synj2Q9D2G5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,7■■■■■ 4,27
Synj2Q9D2G5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC41,7■■■■■ 4,27
Synj2Q9D2G5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC41,69■■■■■ 4,27
Synj2Q9D2G5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,67■■■■■ 4,26
Synj2Q9D2G5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC41,51■■■■■ 4,24
Synj2Q9D2G5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC41,49■■■■■ 4,23
Synj2Q9D2G5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Synj2Q9D2G5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Synj2Q9D2G5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC41,44■■■■■ 4,22
Synj2Q9D2G5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,41■■■■■ 4,22
Synj2Q9D2G5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41,4■■■■■ 4,22
Synj2Q9D2G5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC41,4■■■■■ 4,22
Synj2Q9D2G5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC41,4■■■■■ 4,22
Synj2Q9D2G5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41,39■■■■■ 4,22
Synj2Q9D2G5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC41,38■■■■■ 4,22
Synj2Q9D2G5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC41,37■■■■■ 4,21
Synj2Q9D2G5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
Synj2Q9D2G5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,3■■■■■ 4,2
Synj2Q9D2G5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,27■■■■■ 4,2
Synj2Q9D2G5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,26■■■■■ 4,2
Synj2Q9D2G5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41,26■■■■■ 4,19
Synj2Q9D2G5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC41,24■■■■■ 4,19
Synj2Q9D2G5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41,24■■■■■ 4,19
Synj2Q9D2G5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41,21■■■■■ 4,19
Synj2Q9D2G5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,18■■■■■ 4,18
Synj2Q9D2G5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,17■■■■■ 4,18
Synj2Q9D2G5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,13■■■■■ 4,17
Synj2Q9D2G5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41,12■■■■■ 4,17
Synj2Q9D2G5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC41,12■■■■■ 4,17
Synj2Q9D2G5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Synj2Q9D2G5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
Synj2Q9D2G5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,17
Synj2Q9D2G5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,16
Synj2Q9D2G5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,16
Synj2Q9D2G5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,06■■■■■ 4,16
Synj2Q9D2G5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC41,06■■■■■ 4,16
Synj2Q9D2G5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
Synj2Q9D2G5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,98■■■■■ 4,15
Synj2Q9D2G5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC40,97■■■■■ 4,15
Synj2Q9D2G5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,92■■■■■ 4,14
Synj2Q9D2G5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC40,91■■■■■ 4,14
Synj2Q9D2G5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40,9■■■■■ 4,14
Synj2Q9D2G5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Synj2Q9D2G5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC40,89■■■■■ 4,14
Synj2Q9D2G5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC40,88■■■■■ 4,13
Synj2Q9D2G5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Synj2Q9D2G5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC40,84■■■■■ 4,13
Synj2Q9D2G5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Synj2Q9D2G5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC40,83■■■■■ 4,13
Synj2Q9D2G5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC40,79■■■■■ 4,12
Synj2Q9D2G5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Synj2Q9D2G5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Synj2Q9D2G5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
Synj2Q9D2G5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,72■■■■■ 4,11
Synj2Q9D2G5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Synj2Q9D2G5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC40,66■■■■■ 4,1
Synj2Q9D2G5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Synj2Q9D2G5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Synj2Q9D2G5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Synj2Q9D2G5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
Synj2Q9D2G5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
Synj2Q9D2G5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Synj2Q9D2G5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Synj2Q9D2G5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,1 ms