Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Zbed3Q9D0L1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Zbed3Q9D0L1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Zbed3Q9D0L1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Zbed3Q9D0L1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Zbed3Q9D0L1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Zbed3Q9D0L1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Zbed3Q9D0L1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Zbed3Q9D0L1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Zbed3Q9D0L1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Zbed3Q9D0L1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Zbed3Q9D0L1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Zbed3Q9D0L1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Zbed3Q9D0L1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Zbed3Q9D0L1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Zbed3Q9D0L1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Zbed3Q9D0L1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Zbed3Q9D0L1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Zbed3Q9D0L1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Zbed3Q9D0L1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Zbed3Q9D0L1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Zbed3Q9D0L1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Zbed3Q9D0L1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Zbed3Q9D0L1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Zbed3Q9D0L1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Zbed3Q9D0L1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Zbed3Q9D0L1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Zbed3Q9D0L1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Zbed3Q9D0L1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Zbed3Q9D0L1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Zbed3Q9D0L1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Zbed3Q9D0L1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Zbed3Q9D0L1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Zbed3Q9D0L1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Zbed3Q9D0L1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Zbed3Q9D0L1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Zbed3Q9D0L1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Zbed3Q9D0L1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Zbed3Q9D0L1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Zbed3Q9D0L1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Zbed3Q9D0L1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Zbed3Q9D0L1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Zbed3Q9D0L1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Zbed3Q9D0L1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Zbed3Q9D0L1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Zbed3Q9D0L1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Zbed3Q9D0L1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Zbed3Q9D0L1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Zbed3Q9D0L1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Zbed3Q9D0L1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Zbed3Q9D0L1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Zbed3Q9D0L1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Zbed3Q9D0L1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Zbed3Q9D0L1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Zbed3Q9D0L1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Zbed3Q9D0L1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Zbed3Q9D0L1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Zbed3Q9D0L1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Zbed3Q9D0L1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Zbed3Q9D0L1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Zbed3Q9D0L1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Zbed3Q9D0L1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Zbed3Q9D0L1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Zbed3Q9D0L1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Zbed3Q9D0L1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Zbed3Q9D0L1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Zbed3Q9D0L1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Zbed3Q9D0L1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Zbed3Q9D0L1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Zbed3Q9D0L1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Zbed3Q9D0L1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Zbed3Q9D0L1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Zbed3Q9D0L1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Zbed3Q9D0L1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Zbed3Q9D0L1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Zbed3Q9D0L1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Zbed3Q9D0L1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Zbed3Q9D0L1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Zbed3Q9D0L1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Zbed3Q9D0L1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Zbed3Q9D0L1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Zbed3Q9D0L1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Zbed3Q9D0L1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Zbed3Q9D0L1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Zbed3Q9D0L1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Zbed3Q9D0L1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Zbed3Q9D0L1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Zbed3Q9D0L1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Zbed3Q9D0L1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Zbed3Q9D0L1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Zbed3Q9D0L1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Zbed3Q9D0L1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Zbed3Q9D0L1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Zbed3Q9D0L1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Zbed3Q9D0L1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Zbed3Q9D0L1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Zbed3Q9D0L1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Zbed3Q9D0L1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Zbed3Q9D0L1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
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