Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spc24Q9D083 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spc24Q9D083 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spc24Q9D083 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spc24Q9D083 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spc24Q9D083 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spc24Q9D083 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spc24Q9D083 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spc24Q9D083 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spc24Q9D083 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Spc24Q9D083 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spc24Q9D083 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spc24Q9D083 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spc24Q9D083 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spc24Q9D083 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spc24Q9D083 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Spc24Q9D083 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Spc24Q9D083 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spc24Q9D083 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spc24Q9D083 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spc24Q9D083 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Spc24Q9D083 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Spc24Q9D083 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Spc24Q9D083 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Spc24Q9D083 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Spc24Q9D083 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Spc24Q9D083 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Spc24Q9D083 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Spc24Q9D083 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spc24Q9D083 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Spc24Q9D083 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Spc24Q9D083 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Spc24Q9D083 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Spc24Q9D083 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Spc24Q9D083 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spc24Q9D083 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Spc24Q9D083 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Spc24Q9D083 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spc24Q9D083 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spc24Q9D083 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spc24Q9D083 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spc24Q9D083 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Spc24Q9D083 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spc24Q9D083 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spc24Q9D083 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Spc24Q9D083 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Spc24Q9D083 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Spc24Q9D083 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spc24Q9D083 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Spc24Q9D083 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Spc24Q9D083 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Spc24Q9D083 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spc24Q9D083 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spc24Q9D083 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Spc24Q9D083 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spc24Q9D083 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spc24Q9D083 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spc24Q9D083 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Spc24Q9D083 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Spc24Q9D083 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Spc24Q9D083 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spc24Q9D083 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spc24Q9D083 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Spc24Q9D083 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Spc24Q9D083 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spc24Q9D083 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Spc24Q9D083 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Spc24Q9D083 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spc24Q9D083 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spc24Q9D083 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Spc24Q9D083 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Spc24Q9D083 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spc24Q9D083 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spc24Q9D083 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spc24Q9D083 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spc24Q9D083 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spc24Q9D083 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spc24Q9D083 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spc24Q9D083 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Spc24Q9D083 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spc24Q9D083 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spc24Q9D083 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spc24Q9D083 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spc24Q9D083 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spc24Q9D083 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Spc24Q9D083 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spc24Q9D083 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spc24Q9D083 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spc24Q9D083 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spc24Q9D083 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spc24Q9D083 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spc24Q9D083 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Spc24Q9D083 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Spc24Q9D083 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spc24Q9D083 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Spc24Q9D083 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spc24Q9D083 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Spc24Q9D083 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spc24Q9D083 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spc24Q9D083 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms