Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cmtm8Q9CZR4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cmtm8Q9CZR4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Cmtm8Q9CZR4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cmtm8Q9CZR4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Cmtm8Q9CZR4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Cmtm8Q9CZR4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cmtm8Q9CZR4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Cmtm8Q9CZR4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Cmtm8Q9CZR4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Cmtm8Q9CZR4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cmtm8Q9CZR4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cmtm8Q9CZR4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cmtm8Q9CZR4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cmtm8Q9CZR4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cmtm8Q9CZR4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Cmtm8Q9CZR4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Cmtm8Q9CZR4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cmtm8Q9CZR4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Cmtm8Q9CZR4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cmtm8Q9CZR4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cmtm8Q9CZR4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Cmtm8Q9CZR4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Cmtm8Q9CZR4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Cmtm8Q9CZR4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cmtm8Q9CZR4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Cmtm8Q9CZR4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Cmtm8Q9CZR4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Cmtm8Q9CZR4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Cmtm8Q9CZR4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Cmtm8Q9CZR4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Cmtm8Q9CZR4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Cmtm8Q9CZR4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Cmtm8Q9CZR4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
Cmtm8Q9CZR4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Cmtm8Q9CZR4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Cmtm8Q9CZR4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Cmtm8Q9CZR4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Cmtm8Q9CZR4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Cmtm8Q9CZR4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,55■■■□□ 2
Cmtm8Q9CZR4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,54■■■□□ 2
Cmtm8Q9CZR4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Cmtm8Q9CZR4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Cmtm8Q9CZR4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Cmtm8Q9CZR4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Cmtm8Q9CZR4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Cmtm8Q9CZR4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Cmtm8Q9CZR4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Cmtm8Q9CZR4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Cmtm8Q9CZR4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Cmtm8Q9CZR4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Cmtm8Q9CZR4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cmtm8Q9CZR4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Cmtm8Q9CZR4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cmtm8Q9CZR4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cmtm8Q9CZR4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Cmtm8Q9CZR4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Cmtm8Q9CZR4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Cmtm8Q9CZR4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cmtm8Q9CZR4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cmtm8Q9CZR4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cmtm8Q9CZR4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Cmtm8Q9CZR4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Cmtm8Q9CZR4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cmtm8Q9CZR4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cmtm8Q9CZR4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Cmtm8Q9CZR4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Cmtm8Q9CZR4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cmtm8Q9CZR4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Cmtm8Q9CZR4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Cmtm8Q9CZR4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Cmtm8Q9CZR4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Cmtm8Q9CZR4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
Cmtm8Q9CZR4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Cmtm8Q9CZR4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Cmtm8Q9CZR4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Cmtm8Q9CZR4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Cmtm8Q9CZR4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Cmtm8Q9CZR4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Cmtm8Q9CZR4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Cmtm8Q9CZR4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Cmtm8Q9CZR4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Cmtm8Q9CZR4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Cmtm8Q9CZR4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Cmtm8Q9CZR4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Cmtm8Q9CZR4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Cmtm8Q9CZR4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Cmtm8Q9CZR4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Cmtm8Q9CZR4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Cmtm8Q9CZR4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Cmtm8Q9CZR4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Cmtm8Q9CZR4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Cmtm8Q9CZR4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Cmtm8Q9CZR4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Cmtm8Q9CZR4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Cmtm8Q9CZR4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Cmtm8Q9CZR4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Cmtm8Q9CZR4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Cmtm8Q9CZR4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Cmtm8Q9CZR4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,5 ms