Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
ChtopQ9CY57 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
ChtopQ9CY57 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,73■□□□□ 0,91
ChtopQ9CY57 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
ChtopQ9CY57 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
ChtopQ9CY57 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
ChtopQ9CY57 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
ChtopQ9CY57 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,71■□□□□ 0,91
ChtopQ9CY57 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
ChtopQ9CY57 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
ChtopQ9CY57 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
ChtopQ9CY57 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
ChtopQ9CY57 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,64■□□□□ 0,9
ChtopQ9CY57 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
ChtopQ9CY57 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
ChtopQ9CY57 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,56■□□□□ 0,88
ChtopQ9CY57 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
ChtopQ9CY57 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
ChtopQ9CY57 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
ChtopQ9CY57 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
ChtopQ9CY57 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
ChtopQ9CY57 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
ChtopQ9CY57 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
ChtopQ9CY57 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ChtopQ9CY57 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
ChtopQ9CY57 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
ChtopQ9CY57 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
ChtopQ9CY57 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
ChtopQ9CY57 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,36■□□□□ 0,85
ChtopQ9CY57 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
ChtopQ9CY57 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
ChtopQ9CY57 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
ChtopQ9CY57 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
ChtopQ9CY57 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,33■□□□□ 0,85
ChtopQ9CY57 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
ChtopQ9CY57 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
ChtopQ9CY57 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
ChtopQ9CY57 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,31■□□□□ 0,84
ChtopQ9CY57 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20,3■□□□□ 0,84
ChtopQ9CY57 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20,29■□□□□ 0,84
ChtopQ9CY57 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
ChtopQ9CY57 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
ChtopQ9CY57 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,23■□□□□ 0,83
ChtopQ9CY57 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
ChtopQ9CY57 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20,19■□□□□ 0,82
ChtopQ9CY57 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
ChtopQ9CY57 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
ChtopQ9CY57 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,82
ChtopQ9CY57 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
ChtopQ9CY57 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
ChtopQ9CY57 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
ChtopQ9CY57 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,08■□□□□ 0,81
ChtopQ9CY57 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
ChtopQ9CY57 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
ChtopQ9CY57 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20,05■□□□□ 0,8
ChtopQ9CY57 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
ChtopQ9CY57 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,04■□□□□ 0,8
ChtopQ9CY57 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
ChtopQ9CY57 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
ChtopQ9CY57 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,01■□□□□ 0,79
ChtopQ9CY57 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
ChtopQ9CY57 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
ChtopQ9CY57 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
ChtopQ9CY57 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
ChtopQ9CY57 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19,98■□□□□ 0,79
ChtopQ9CY57 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
ChtopQ9CY57 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
ChtopQ9CY57 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
ChtopQ9CY57 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
ChtopQ9CY57 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
ChtopQ9CY57 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
ChtopQ9CY57 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
ChtopQ9CY57 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
ChtopQ9CY57 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
ChtopQ9CY57 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
ChtopQ9CY57 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
ChtopQ9CY57 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
ChtopQ9CY57 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
ChtopQ9CY57 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
ChtopQ9CY57 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
ChtopQ9CY57 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
ChtopQ9CY57 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
ChtopQ9CY57 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
ChtopQ9CY57 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19,84■□□□□ 0,77
ChtopQ9CY57 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
ChtopQ9CY57 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19,83■□□□□ 0,76
ChtopQ9CY57 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
ChtopQ9CY57 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19,83■□□□□ 0,76
ChtopQ9CY57 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
ChtopQ9CY57 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
ChtopQ9CY57 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
ChtopQ9CY57 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
ChtopQ9CY57 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
ChtopQ9CY57 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
ChtopQ9CY57 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
ChtopQ9CY57 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
ChtopQ9CY57 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
ChtopQ9CY57 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19,76■□□□□ 0,75
ChtopQ9CY57 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
ChtopQ9CY57 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms