Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Yif1bQ9CX30 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Yif1bQ9CX30 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Yif1bQ9CX30 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Yif1bQ9CX30 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Yif1bQ9CX30 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Yif1bQ9CX30 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Yif1bQ9CX30 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Yif1bQ9CX30 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Yif1bQ9CX30 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,76
Yif1bQ9CX30 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Yif1bQ9CX30 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Yif1bQ9CX30 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Yif1bQ9CX30 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Yif1bQ9CX30 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Yif1bQ9CX30 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Yif1bQ9CX30 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Yif1bQ9CX30 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Yif1bQ9CX30 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Yif1bQ9CX30 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Yif1bQ9CX30 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Yif1bQ9CX30 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Yif1bQ9CX30 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Yif1bQ9CX30 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Yif1bQ9CX30 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Yif1bQ9CX30 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Yif1bQ9CX30 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Yif1bQ9CX30 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Yif1bQ9CX30 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Yif1bQ9CX30 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Yif1bQ9CX30 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Yif1bQ9CX30 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Yif1bQ9CX30 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Yif1bQ9CX30 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Yif1bQ9CX30 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Yif1bQ9CX30 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Yif1bQ9CX30 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Yif1bQ9CX30 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Yif1bQ9CX30 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Yif1bQ9CX30 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Yif1bQ9CX30 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Yif1bQ9CX30 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Yif1bQ9CX30 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Yif1bQ9CX30 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Yif1bQ9CX30 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Yif1bQ9CX30 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Yif1bQ9CX30 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Yif1bQ9CX30 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Yif1bQ9CX30 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Yif1bQ9CX30 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Yif1bQ9CX30 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Yif1bQ9CX30 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Yif1bQ9CX30 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Yif1bQ9CX30 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Yif1bQ9CX30 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Yif1bQ9CX30 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Yif1bQ9CX30 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Yif1bQ9CX30 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Yif1bQ9CX30 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Yif1bQ9CX30 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Yif1bQ9CX30 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Yif1bQ9CX30 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Yif1bQ9CX30 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Yif1bQ9CX30 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Yif1bQ9CX30 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Yif1bQ9CX30 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Yif1bQ9CX30 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Yif1bQ9CX30 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Yif1bQ9CX30 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Yif1bQ9CX30 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Yif1bQ9CX30 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Yif1bQ9CX30 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Yif1bQ9CX30 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Yif1bQ9CX30 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Yif1bQ9CX30 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Yif1bQ9CX30 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Yif1bQ9CX30 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Yif1bQ9CX30 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Yif1bQ9CX30 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Yif1bQ9CX30 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,13■■□□□ 1,61
Yif1bQ9CX30 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Yif1bQ9CX30 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Yif1bQ9CX30 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Yif1bQ9CX30 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Yif1bQ9CX30 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Yif1bQ9CX30 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Yif1bQ9CX30 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Yif1bQ9CX30 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Yif1bQ9CX30 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Yif1bQ9CX30 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Yif1bQ9CX30 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Yif1bQ9CX30 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Yif1bQ9CX30 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Yif1bQ9CX30 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Yif1bQ9CX30 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Yif1bQ9CX30 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Yif1bQ9CX30 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Yif1bQ9CX30 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Yif1bQ9CX30 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,57
Yif1bQ9CX30 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,88■■□□□ 1,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,3 ms