Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX19

Fam162b, Protein FAM162B, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam162bQ9CX19 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam162bQ9CX19 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam162bQ9CX19 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam162bQ9CX19 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam162bQ9CX19 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam162bQ9CX19 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam162bQ9CX19 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam162bQ9CX19 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam162bQ9CX19 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam162bQ9CX19 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam162bQ9CX19 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam162bQ9CX19 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam162bQ9CX19 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam162bQ9CX19 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam162bQ9CX19 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam162bQ9CX19 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam162bQ9CX19 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam162bQ9CX19 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam162bQ9CX19 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam162bQ9CX19 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam162bQ9CX19 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam162bQ9CX19 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam162bQ9CX19 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam162bQ9CX19 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam162bQ9CX19 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam162bQ9CX19 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam162bQ9CX19 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam162bQ9CX19 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam162bQ9CX19 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam162bQ9CX19 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam162bQ9CX19 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam162bQ9CX19 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam162bQ9CX19 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam162bQ9CX19 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam162bQ9CX19 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam162bQ9CX19 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam162bQ9CX19 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam162bQ9CX19 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam162bQ9CX19 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam162bQ9CX19 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam162bQ9CX19 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam162bQ9CX19 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam162bQ9CX19 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam162bQ9CX19 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam162bQ9CX19 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam162bQ9CX19 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam162bQ9CX19 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam162bQ9CX19 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam162bQ9CX19 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam162bQ9CX19 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam162bQ9CX19 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam162bQ9CX19 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam162bQ9CX19 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam162bQ9CX19 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam162bQ9CX19 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam162bQ9CX19 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam162bQ9CX19 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam162bQ9CX19 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam162bQ9CX19 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam162bQ9CX19 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam162bQ9CX19 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam162bQ9CX19 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam162bQ9CX19 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam162bQ9CX19 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam162bQ9CX19 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam162bQ9CX19 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam162bQ9CX19 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam162bQ9CX19 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam162bQ9CX19 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam162bQ9CX19 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam162bQ9CX19 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam162bQ9CX19 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam162bQ9CX19 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam162bQ9CX19 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam162bQ9CX19 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam162bQ9CX19 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam162bQ9CX19 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam162bQ9CX19 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam162bQ9CX19 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam162bQ9CX19 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam162bQ9CX19 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam162bQ9CX19 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam162bQ9CX19 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam162bQ9CX19 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam162bQ9CX19 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam162bQ9CX19 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam162bQ9CX19 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam162bQ9CX19 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam162bQ9CX19 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam162bQ9CX19 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam162bQ9CX19 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam162bQ9CX19 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam162bQ9CX19 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam162bQ9CX19 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam162bQ9CX19 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam162bQ9CX19 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam162bQ9CX19 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam162bQ9CX19 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam162bQ9CX19 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam162bQ9CX19 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms