Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnih4Q9CX13 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnih4Q9CX13 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnih4Q9CX13 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnih4Q9CX13 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnih4Q9CX13 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnih4Q9CX13 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnih4Q9CX13 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnih4Q9CX13 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnih4Q9CX13 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnih4Q9CX13 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnih4Q9CX13 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnih4Q9CX13 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnih4Q9CX13 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnih4Q9CX13 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnih4Q9CX13 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnih4Q9CX13 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnih4Q9CX13 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnih4Q9CX13 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnih4Q9CX13 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnih4Q9CX13 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnih4Q9CX13 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnih4Q9CX13 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnih4Q9CX13 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnih4Q9CX13 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnih4Q9CX13 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnih4Q9CX13 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnih4Q9CX13 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnih4Q9CX13 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnih4Q9CX13 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnih4Q9CX13 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnih4Q9CX13 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnih4Q9CX13 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnih4Q9CX13 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnih4Q9CX13 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnih4Q9CX13 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnih4Q9CX13 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnih4Q9CX13 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnih4Q9CX13 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnih4Q9CX13 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnih4Q9CX13 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnih4Q9CX13 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnih4Q9CX13 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnih4Q9CX13 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnih4Q9CX13 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnih4Q9CX13 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnih4Q9CX13 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnih4Q9CX13 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnih4Q9CX13 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnih4Q9CX13 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnih4Q9CX13 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnih4Q9CX13 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnih4Q9CX13 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnih4Q9CX13 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnih4Q9CX13 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnih4Q9CX13 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnih4Q9CX13 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnih4Q9CX13 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnih4Q9CX13 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnih4Q9CX13 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnih4Q9CX13 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnih4Q9CX13 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnih4Q9CX13 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnih4Q9CX13 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnih4Q9CX13 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnih4Q9CX13 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnih4Q9CX13 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnih4Q9CX13 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnih4Q9CX13 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnih4Q9CX13 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnih4Q9CX13 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnih4Q9CX13 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cnih4Q9CX13 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnih4Q9CX13 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnih4Q9CX13 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnih4Q9CX13 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnih4Q9CX13 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnih4Q9CX13 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnih4Q9CX13 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnih4Q9CX13 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnih4Q9CX13 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnih4Q9CX13 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnih4Q9CX13 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnih4Q9CX13 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnih4Q9CX13 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnih4Q9CX13 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnih4Q9CX13 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnih4Q9CX13 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnih4Q9CX13 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnih4Q9CX13 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnih4Q9CX13 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnih4Q9CX13 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnih4Q9CX13 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnih4Q9CX13 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnih4Q9CX13 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnih4Q9CX13 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnih4Q9CX13 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnih4Q9CX13 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnih4Q9CX13 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnih4Q9CX13 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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