Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gnpda2Q9CRC9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gnpda2Q9CRC9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gnpda2Q9CRC9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gnpda2Q9CRC9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gnpda2Q9CRC9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gnpda2Q9CRC9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gnpda2Q9CRC9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gnpda2Q9CRC9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gnpda2Q9CRC9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gnpda2Q9CRC9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gnpda2Q9CRC9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gnpda2Q9CRC9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gnpda2Q9CRC9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gnpda2Q9CRC9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gnpda2Q9CRC9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gnpda2Q9CRC9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gnpda2Q9CRC9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gnpda2Q9CRC9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gnpda2Q9CRC9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gnpda2Q9CRC9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gnpda2Q9CRC9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gnpda2Q9CRC9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gnpda2Q9CRC9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gnpda2Q9CRC9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gnpda2Q9CRC9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gnpda2Q9CRC9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gnpda2Q9CRC9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gnpda2Q9CRC9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gnpda2Q9CRC9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gnpda2Q9CRC9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gnpda2Q9CRC9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gnpda2Q9CRC9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gnpda2Q9CRC9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gnpda2Q9CRC9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gnpda2Q9CRC9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gnpda2Q9CRC9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gnpda2Q9CRC9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gnpda2Q9CRC9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gnpda2Q9CRC9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gnpda2Q9CRC9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gnpda2Q9CRC9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnpda2Q9CRC9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gnpda2Q9CRC9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnpda2Q9CRC9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnpda2Q9CRC9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnpda2Q9CRC9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnpda2Q9CRC9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnpda2Q9CRC9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnpda2Q9CRC9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnpda2Q9CRC9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnpda2Q9CRC9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnpda2Q9CRC9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnpda2Q9CRC9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnpda2Q9CRC9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gnpda2Q9CRC9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gnpda2Q9CRC9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gnpda2Q9CRC9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gnpda2Q9CRC9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gnpda2Q9CRC9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gnpda2Q9CRC9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gnpda2Q9CRC9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gnpda2Q9CRC9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gnpda2Q9CRC9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gnpda2Q9CRC9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gnpda2Q9CRC9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gnpda2Q9CRC9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gnpda2Q9CRC9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gnpda2Q9CRC9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gnpda2Q9CRC9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gnpda2Q9CRC9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gnpda2Q9CRC9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gnpda2Q9CRC9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gnpda2Q9CRC9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gnpda2Q9CRC9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gnpda2Q9CRC9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gnpda2Q9CRC9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gnpda2Q9CRC9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gnpda2Q9CRC9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gnpda2Q9CRC9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gnpda2Q9CRC9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gnpda2Q9CRC9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gnpda2Q9CRC9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gnpda2Q9CRC9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gnpda2Q9CRC9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gnpda2Q9CRC9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gnpda2Q9CRC9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gnpda2Q9CRC9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gnpda2Q9CRC9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gnpda2Q9CRC9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gnpda2Q9CRC9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gnpda2Q9CRC9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gnpda2Q9CRC9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gnpda2Q9CRC9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gnpda2Q9CRC9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gnpda2Q9CRC9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gnpda2Q9CRC9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gnpda2Q9CRC9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gnpda2Q9CRC9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms