Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9CRC3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CRC3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CRC3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q9CRC3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9CRC3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9CRC3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CRC3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9CRC3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CRC3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CRC3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9CRC3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9CRC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9CRC3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CRC3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CRC3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CRC3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CRC3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CRC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CRC3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CRC3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CRC3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9CRC3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CRC3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CRC3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CRC3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CRC3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CRC3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CRC3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CRC3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CRC3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CRC3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CRC3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CRC3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CRC3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CRC3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CRC3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CRC3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CRC3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CRC3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CRC3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CRC3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CRC3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q9CRC3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CRC3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CRC3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CRC3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CRC3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CRC3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CRC3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CRC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CRC3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CRC3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CRC3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CRC3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CRC3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CRC3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CRC3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CRC3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CRC3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CRC3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CRC3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CRC3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CRC3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CRC3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CRC3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CRC3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9CRC3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CRC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CRC3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CRC3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CRC3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CRC3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CRC3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CRC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CRC3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CRC3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CRC3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CRC3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9CRC3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9CRC3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9CRC3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9CRC3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9CRC3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CRC3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CRC3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CRC3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CRC3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9CRC3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9CRC3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9CRC3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CRC3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CRC3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CRC3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CRC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9CRC3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CRC3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CRC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CRC3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CRC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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