Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctrb1Q9CR35 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctrb1Q9CR35 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctrb1Q9CR35 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctrb1Q9CR35 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctrb1Q9CR35 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctrb1Q9CR35 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctrb1Q9CR35 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctrb1Q9CR35 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctrb1Q9CR35 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctrb1Q9CR35 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctrb1Q9CR35 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctrb1Q9CR35 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctrb1Q9CR35 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctrb1Q9CR35 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctrb1Q9CR35 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctrb1Q9CR35 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctrb1Q9CR35 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctrb1Q9CR35 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctrb1Q9CR35 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctrb1Q9CR35 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ctrb1Q9CR35 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctrb1Q9CR35 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctrb1Q9CR35 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctrb1Q9CR35 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctrb1Q9CR35 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctrb1Q9CR35 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctrb1Q9CR35 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctrb1Q9CR35 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctrb1Q9CR35 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctrb1Q9CR35 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctrb1Q9CR35 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctrb1Q9CR35 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctrb1Q9CR35 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctrb1Q9CR35 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctrb1Q9CR35 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctrb1Q9CR35 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctrb1Q9CR35 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctrb1Q9CR35 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctrb1Q9CR35 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctrb1Q9CR35 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctrb1Q9CR35 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctrb1Q9CR35 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctrb1Q9CR35 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctrb1Q9CR35 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctrb1Q9CR35 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctrb1Q9CR35 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctrb1Q9CR35 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctrb1Q9CR35 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctrb1Q9CR35 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctrb1Q9CR35 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctrb1Q9CR35 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctrb1Q9CR35 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctrb1Q9CR35 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctrb1Q9CR35 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctrb1Q9CR35 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctrb1Q9CR35 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctrb1Q9CR35 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctrb1Q9CR35 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctrb1Q9CR35 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctrb1Q9CR35 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctrb1Q9CR35 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctrb1Q9CR35 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctrb1Q9CR35 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctrb1Q9CR35 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctrb1Q9CR35 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctrb1Q9CR35 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctrb1Q9CR35 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctrb1Q9CR35 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctrb1Q9CR35 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctrb1Q9CR35 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctrb1Q9CR35 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctrb1Q9CR35 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctrb1Q9CR35 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctrb1Q9CR35 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctrb1Q9CR35 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctrb1Q9CR35 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctrb1Q9CR35 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctrb1Q9CR35 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctrb1Q9CR35 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctrb1Q9CR35 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctrb1Q9CR35 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctrb1Q9CR35 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctrb1Q9CR35 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctrb1Q9CR35 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctrb1Q9CR35 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctrb1Q9CR35 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctrb1Q9CR35 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctrb1Q9CR35 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctrb1Q9CR35 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctrb1Q9CR35 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctrb1Q9CR35 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctrb1Q9CR35 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctrb1Q9CR35 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctrb1Q9CR35 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctrb1Q9CR35 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctrb1Q9CR35 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctrb1Q9CR35 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctrb1Q9CR35 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctrb1Q9CR35 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms