Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR04

Hypm, Huntingtin-interacting protein M, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HypmQ9CR04 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HypmQ9CR04 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HypmQ9CR04 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HypmQ9CR04 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HypmQ9CR04 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HypmQ9CR04 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HypmQ9CR04 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HypmQ9CR04 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HypmQ9CR04 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HypmQ9CR04 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HypmQ9CR04 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HypmQ9CR04 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HypmQ9CR04 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HypmQ9CR04 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HypmQ9CR04 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HypmQ9CR04 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HypmQ9CR04 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HypmQ9CR04 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HypmQ9CR04 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HypmQ9CR04 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HypmQ9CR04 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HypmQ9CR04 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HypmQ9CR04 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HypmQ9CR04 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HypmQ9CR04 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HypmQ9CR04 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HypmQ9CR04 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HypmQ9CR04 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HypmQ9CR04 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HypmQ9CR04 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HypmQ9CR04 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HypmQ9CR04 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HypmQ9CR04 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HypmQ9CR04 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HypmQ9CR04 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HypmQ9CR04 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HypmQ9CR04 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HypmQ9CR04 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HypmQ9CR04 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HypmQ9CR04 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HypmQ9CR04 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HypmQ9CR04 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HypmQ9CR04 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HypmQ9CR04 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HypmQ9CR04 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HypmQ9CR04 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HypmQ9CR04 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HypmQ9CR04 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HypmQ9CR04 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HypmQ9CR04 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HypmQ9CR04 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HypmQ9CR04 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HypmQ9CR04 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HypmQ9CR04 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HypmQ9CR04 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HypmQ9CR04 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HypmQ9CR04 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HypmQ9CR04 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HypmQ9CR04 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HypmQ9CR04 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HypmQ9CR04 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HypmQ9CR04 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HypmQ9CR04 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HypmQ9CR04 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HypmQ9CR04 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HypmQ9CR04 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HypmQ9CR04 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HypmQ9CR04 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HypmQ9CR04 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HypmQ9CR04 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HypmQ9CR04 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HypmQ9CR04 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HypmQ9CR04 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HypmQ9CR04 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HypmQ9CR04 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HypmQ9CR04 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HypmQ9CR04 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HypmQ9CR04 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HypmQ9CR04 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HypmQ9CR04 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HypmQ9CR04 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HypmQ9CR04 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HypmQ9CR04 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HypmQ9CR04 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HypmQ9CR04 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HypmQ9CR04 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HypmQ9CR04 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HypmQ9CR04 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HypmQ9CR04 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HypmQ9CR04 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HypmQ9CR04 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HypmQ9CR04 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HypmQ9CR04 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HypmQ9CR04 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HypmQ9CR04 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HypmQ9CR04 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HypmQ9CR04 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HypmQ9CR04 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HypmQ9CR04 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HypmQ9CR04 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms