Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg12Q9CQY1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg12Q9CQY1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg12Q9CQY1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg12Q9CQY1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg12Q9CQY1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg12Q9CQY1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg12Q9CQY1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg12Q9CQY1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg12Q9CQY1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg12Q9CQY1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg12Q9CQY1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg12Q9CQY1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg12Q9CQY1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg12Q9CQY1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg12Q9CQY1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg12Q9CQY1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg12Q9CQY1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg12Q9CQY1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg12Q9CQY1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg12Q9CQY1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg12Q9CQY1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg12Q9CQY1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg12Q9CQY1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg12Q9CQY1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg12Q9CQY1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg12Q9CQY1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg12Q9CQY1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg12Q9CQY1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg12Q9CQY1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg12Q9CQY1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg12Q9CQY1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg12Q9CQY1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg12Q9CQY1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg12Q9CQY1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg12Q9CQY1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg12Q9CQY1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg12Q9CQY1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg12Q9CQY1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg12Q9CQY1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg12Q9CQY1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg12Q9CQY1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg12Q9CQY1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg12Q9CQY1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg12Q9CQY1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg12Q9CQY1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg12Q9CQY1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg12Q9CQY1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg12Q9CQY1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg12Q9CQY1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg12Q9CQY1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg12Q9CQY1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg12Q9CQY1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg12Q9CQY1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg12Q9CQY1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg12Q9CQY1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg12Q9CQY1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg12Q9CQY1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg12Q9CQY1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg12Q9CQY1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg12Q9CQY1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg12Q9CQY1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg12Q9CQY1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg12Q9CQY1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg12Q9CQY1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg12Q9CQY1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg12Q9CQY1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg12Q9CQY1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg12Q9CQY1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg12Q9CQY1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg12Q9CQY1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg12Q9CQY1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg12Q9CQY1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg12Q9CQY1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg12Q9CQY1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg12Q9CQY1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg12Q9CQY1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg12Q9CQY1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg12Q9CQY1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg12Q9CQY1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg12Q9CQY1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg12Q9CQY1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg12Q9CQY1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg12Q9CQY1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg12Q9CQY1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg12Q9CQY1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg12Q9CQY1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg12Q9CQY1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg12Q9CQY1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg12Q9CQY1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg12Q9CQY1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg12Q9CQY1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg12Q9CQY1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg12Q9CQY1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg12Q9CQY1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg12Q9CQY1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg12Q9CQY1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg12Q9CQY1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg12Q9CQY1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg12Q9CQY1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms