Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Gkn2Q9CQS6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Gkn2Q9CQS6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Gkn2Q9CQS6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Gkn2Q9CQS6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Gkn2Q9CQS6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Gkn2Q9CQS6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Gkn2Q9CQS6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Gkn2Q9CQS6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Gkn2Q9CQS6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Gkn2Q9CQS6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Gkn2Q9CQS6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Gkn2Q9CQS6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Gkn2Q9CQS6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Gkn2Q9CQS6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Gkn2Q9CQS6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Gkn2Q9CQS6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gkn2Q9CQS6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gkn2Q9CQS6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,84■■□□□ 1,73
Gkn2Q9CQS6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Gkn2Q9CQS6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Gkn2Q9CQS6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gkn2Q9CQS6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gkn2Q9CQS6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Gkn2Q9CQS6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,71
Gkn2Q9CQS6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
Gkn2Q9CQS6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gkn2Q9CQS6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Gkn2Q9CQS6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Gkn2Q9CQS6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,64■■□□□ 1,69
Gkn2Q9CQS6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gkn2Q9CQS6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gkn2Q9CQS6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gkn2Q9CQS6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gkn2Q9CQS6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gkn2Q9CQS6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gkn2Q9CQS6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gkn2Q9CQS6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gkn2Q9CQS6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gkn2Q9CQS6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gkn2Q9CQS6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gkn2Q9CQS6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gkn2Q9CQS6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gkn2Q9CQS6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gkn2Q9CQS6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gkn2Q9CQS6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gkn2Q9CQS6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gkn2Q9CQS6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gkn2Q9CQS6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gkn2Q9CQS6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gkn2Q9CQS6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Gkn2Q9CQS6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Gkn2Q9CQS6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Gkn2Q9CQS6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gkn2Q9CQS6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gkn2Q9CQS6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gkn2Q9CQS6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gkn2Q9CQS6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gkn2Q9CQS6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Gkn2Q9CQS6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gkn2Q9CQS6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gkn2Q9CQS6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gkn2Q9CQS6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gkn2Q9CQS6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gkn2Q9CQS6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Gkn2Q9CQS6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Gkn2Q9CQS6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gkn2Q9CQS6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gkn2Q9CQS6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gkn2Q9CQS6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Gkn2Q9CQS6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gkn2Q9CQS6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Gkn2Q9CQS6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gkn2Q9CQS6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Gkn2Q9CQS6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Gkn2Q9CQS6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gkn2Q9CQS6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gkn2Q9CQS6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Gkn2Q9CQS6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Gkn2Q9CQS6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gkn2Q9CQS6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Gkn2Q9CQS6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1,59
Gkn2Q9CQS6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,99■■□□□ 1,59
Gkn2Q9CQS6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Gkn2Q9CQS6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Gkn2Q9CQS6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Gkn2Q9CQS6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Gkn2Q9CQS6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Gkn2Q9CQS6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Gkn2Q9CQS6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,89■■□□□ 1,57
Gkn2Q9CQS6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Gkn2Q9CQS6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Gkn2Q9CQS6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,86■■□□□ 1,57
Gkn2Q9CQS6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gkn2Q9CQS6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gkn2Q9CQS6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Gkn2Q9CQS6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Gkn2Q9CQS6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Gkn2Q9CQS6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Gkn2Q9CQS6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,6 ms