Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Sar1bQ9CQC9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Sar1bQ9CQC9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Sar1bQ9CQC9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Sar1bQ9CQC9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Sar1bQ9CQC9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Sar1bQ9CQC9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Sar1bQ9CQC9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Sar1bQ9CQC9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Sar1bQ9CQC9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Sar1bQ9CQC9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Sar1bQ9CQC9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Sar1bQ9CQC9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Sar1bQ9CQC9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Sar1bQ9CQC9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Sar1bQ9CQC9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Sar1bQ9CQC9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Sar1bQ9CQC9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Sar1bQ9CQC9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Sar1bQ9CQC9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Sar1bQ9CQC9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Sar1bQ9CQC9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Sar1bQ9CQC9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Sar1bQ9CQC9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Sar1bQ9CQC9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Sar1bQ9CQC9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Sar1bQ9CQC9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Sar1bQ9CQC9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Sar1bQ9CQC9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Sar1bQ9CQC9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Sar1bQ9CQC9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Sar1bQ9CQC9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Sar1bQ9CQC9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Sar1bQ9CQC9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Sar1bQ9CQC9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Sar1bQ9CQC9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Sar1bQ9CQC9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Sar1bQ9CQC9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Sar1bQ9CQC9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,39■■■□□ 2,13
Sar1bQ9CQC9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Sar1bQ9CQC9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Sar1bQ9CQC9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Sar1bQ9CQC9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Sar1bQ9CQC9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Sar1bQ9CQC9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Sar1bQ9CQC9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Sar1bQ9CQC9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Sar1bQ9CQC9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Sar1bQ9CQC9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Sar1bQ9CQC9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Sar1bQ9CQC9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Sar1bQ9CQC9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Sar1bQ9CQC9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Sar1bQ9CQC9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Sar1bQ9CQC9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Sar1bQ9CQC9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Sar1bQ9CQC9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Sar1bQ9CQC9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Sar1bQ9CQC9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Sar1bQ9CQC9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Sar1bQ9CQC9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Sar1bQ9CQC9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Sar1bQ9CQC9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Sar1bQ9CQC9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Sar1bQ9CQC9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Sar1bQ9CQC9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Sar1bQ9CQC9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Sar1bQ9CQC9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Sar1bQ9CQC9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Sar1bQ9CQC9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Sar1bQ9CQC9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Sar1bQ9CQC9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Sar1bQ9CQC9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Sar1bQ9CQC9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Sar1bQ9CQC9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Sar1bQ9CQC9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Sar1bQ9CQC9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Sar1bQ9CQC9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Sar1bQ9CQC9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Sar1bQ9CQC9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Sar1bQ9CQC9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Sar1bQ9CQC9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Sar1bQ9CQC9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Sar1bQ9CQC9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Sar1bQ9CQC9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Sar1bQ9CQC9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Sar1bQ9CQC9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Sar1bQ9CQC9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Sar1bQ9CQC9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Sar1bQ9CQC9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
Sar1bQ9CQC9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Sar1bQ9CQC9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Sar1bQ9CQC9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Sar1bQ9CQC9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Sar1bQ9CQC9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Sar1bQ9CQC9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Sar1bQ9CQC9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Sar1bQ9CQC9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Sar1bQ9CQC9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Sar1bQ9CQC9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms