Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl49Q9CQ40 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrpl49Q9CQ40 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrpl49Q9CQ40 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mrpl49Q9CQ40 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mrpl49Q9CQ40 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mrpl49Q9CQ40 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mrpl49Q9CQ40 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mrpl49Q9CQ40 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Mrpl49Q9CQ40 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mrpl49Q9CQ40 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mrpl49Q9CQ40 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mrpl49Q9CQ40 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mrpl49Q9CQ40 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mrpl49Q9CQ40 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mrpl49Q9CQ40 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mrpl49Q9CQ40 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mrpl49Q9CQ40 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl49Q9CQ40 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl49Q9CQ40 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl49Q9CQ40 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl49Q9CQ40 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl49Q9CQ40 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl49Q9CQ40 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl49Q9CQ40 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl49Q9CQ40 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl49Q9CQ40 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mrpl49Q9CQ40 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl49Q9CQ40 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mrpl49Q9CQ40 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mrpl49Q9CQ40 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mrpl49Q9CQ40 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrpl49Q9CQ40 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrpl49Q9CQ40 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrpl49Q9CQ40 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrpl49Q9CQ40 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrpl49Q9CQ40 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrpl49Q9CQ40 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrpl49Q9CQ40 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mrpl49Q9CQ40 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mrpl49Q9CQ40 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrpl49Q9CQ40 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mrpl49Q9CQ40 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mrpl49Q9CQ40 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mrpl49Q9CQ40 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl49Q9CQ40 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl49Q9CQ40 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl49Q9CQ40 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl49Q9CQ40 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrpl49Q9CQ40 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl49Q9CQ40 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl49Q9CQ40 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl49Q9CQ40 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl49Q9CQ40 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl49Q9CQ40 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl49Q9CQ40 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrpl49Q9CQ40 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl49Q9CQ40 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrpl49Q9CQ40 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrpl49Q9CQ40 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrpl49Q9CQ40 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl49Q9CQ40 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl49Q9CQ40 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl49Q9CQ40 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl49Q9CQ40 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrpl49Q9CQ40 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrpl49Q9CQ40 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl49Q9CQ40 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl49Q9CQ40 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl49Q9CQ40 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mrpl49Q9CQ40 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl49Q9CQ40 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl49Q9CQ40 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl49Q9CQ40 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl49Q9CQ40 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl49Q9CQ40 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl49Q9CQ40 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl49Q9CQ40 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl49Q9CQ40 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl49Q9CQ40 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl49Q9CQ40 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl49Q9CQ40 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl49Q9CQ40 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl49Q9CQ40 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl49Q9CQ40 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl49Q9CQ40 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl49Q9CQ40 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl49Q9CQ40 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl49Q9CQ40 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mrpl49Q9CQ40 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl49Q9CQ40 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl49Q9CQ40 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl49Q9CQ40 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl49Q9CQ40 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl49Q9CQ40 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mrpl49Q9CQ40 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl49Q9CQ40 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl49Q9CQ40 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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