Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Chmp3Q9CQ10 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Chmp3Q9CQ10 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,43■■■■□ 3,1
Chmp3Q9CQ10 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Chmp3Q9CQ10 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Chmp3Q9CQ10 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Chmp3Q9CQ10 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Chmp3Q9CQ10 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Chmp3Q9CQ10 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Chmp3Q9CQ10 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Chmp3Q9CQ10 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Chmp3Q9CQ10 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Chmp3Q9CQ10 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Chmp3Q9CQ10 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Chmp3Q9CQ10 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Chmp3Q9CQ10 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Chmp3Q9CQ10 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Chmp3Q9CQ10 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Chmp3Q9CQ10 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Chmp3Q9CQ10 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
Chmp3Q9CQ10 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Chmp3Q9CQ10 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Chmp3Q9CQ10 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Chmp3Q9CQ10 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Chmp3Q9CQ10 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Chmp3Q9CQ10 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Chmp3Q9CQ10 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,92■■■■□ 3,02
Chmp3Q9CQ10 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Chmp3Q9CQ10 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Chmp3Q9CQ10 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,79■■■■□ 3
Chmp3Q9CQ10 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Chmp3Q9CQ10 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Chmp3Q9CQ10 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Chmp3Q9CQ10 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Chmp3Q9CQ10 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Chmp3Q9CQ10 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Chmp3Q9CQ10 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Chmp3Q9CQ10 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,97
Chmp3Q9CQ10 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Chmp3Q9CQ10 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Chmp3Q9CQ10 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,53■■■□□ 2,96
Chmp3Q9CQ10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Chmp3Q9CQ10 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Chmp3Q9CQ10 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Chmp3Q9CQ10 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Chmp3Q9CQ10 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,46■■■□□ 2,95
Chmp3Q9CQ10 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Chmp3Q9CQ10 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Chmp3Q9CQ10 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Chmp3Q9CQ10 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Chmp3Q9CQ10 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Chmp3Q9CQ10 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Chmp3Q9CQ10 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33,32■■■□□ 2,92
Chmp3Q9CQ10 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,32■■■□□ 2,92
Chmp3Q9CQ10 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Chmp3Q9CQ10 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Chmp3Q9CQ10 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,29■■■□□ 2,92
Chmp3Q9CQ10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Chmp3Q9CQ10 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Chmp3Q9CQ10 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,26■■■□□ 2,91
Chmp3Q9CQ10 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Chmp3Q9CQ10 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,9
Chmp3Q9CQ10 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Chmp3Q9CQ10 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Chmp3Q9CQ10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Chmp3Q9CQ10 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Chmp3Q9CQ10 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Chmp3Q9CQ10 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Chmp3Q9CQ10 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Chmp3Q9CQ10 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Chmp3Q9CQ10 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Chmp3Q9CQ10 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,87■■■□□ 2,85
Chmp3Q9CQ10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,87■■■□□ 2,85
Chmp3Q9CQ10 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Chmp3Q9CQ10 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Chmp3Q9CQ10 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Chmp3Q9CQ10 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Chmp3Q9CQ10 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Chmp3Q9CQ10 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Chmp3Q9CQ10 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Chmp3Q9CQ10 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Chmp3Q9CQ10 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Chmp3Q9CQ10 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Chmp3Q9CQ10 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Chmp3Q9CQ10 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Chmp3Q9CQ10 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Chmp3Q9CQ10 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Chmp3Q9CQ10 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Chmp3Q9CQ10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Chmp3Q9CQ10 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Chmp3Q9CQ10 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Chmp3Q9CQ10 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Chmp3Q9CQ10 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Chmp3Q9CQ10 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Chmp3Q9CQ10 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Chmp3Q9CQ10 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Chmp3Q9CQ10 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Chmp3Q9CQ10 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,53■■■□□ 2,8
Chmp3Q9CQ10 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
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