Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Atg3Q9CPX6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Atg3Q9CPX6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Atg3Q9CPX6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Atg3Q9CPX6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Atg3Q9CPX6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Atg3Q9CPX6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Atg3Q9CPX6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Atg3Q9CPX6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Atg3Q9CPX6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36,23■■■■□ 3,39
Atg3Q9CPX6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36,21■■■■□ 3,39
Atg3Q9CPX6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Atg3Q9CPX6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,37
Atg3Q9CPX6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,07■■■■□ 3,36
Atg3Q9CPX6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,02■■■■□ 3,36
Atg3Q9CPX6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Atg3Q9CPX6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Atg3Q9CPX6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,96■■■■□ 3,35
Atg3Q9CPX6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Atg3Q9CPX6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Atg3Q9CPX6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Atg3Q9CPX6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Atg3Q9CPX6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Atg3Q9CPX6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Atg3Q9CPX6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Atg3Q9CPX6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Atg3Q9CPX6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Atg3Q9CPX6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Atg3Q9CPX6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Atg3Q9CPX6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Atg3Q9CPX6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35,48■■■■□ 3,27
Atg3Q9CPX6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Atg3Q9CPX6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Atg3Q9CPX6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Atg3Q9CPX6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Atg3Q9CPX6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Atg3Q9CPX6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Atg3Q9CPX6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Atg3Q9CPX6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Atg3Q9CPX6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Atg3Q9CPX6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Atg3Q9CPX6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Atg3Q9CPX6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35,36■■■■□ 3,25
Atg3Q9CPX6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Atg3Q9CPX6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,25
Atg3Q9CPX6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35,32■■■■□ 3,24
Atg3Q9CPX6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Atg3Q9CPX6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Atg3Q9CPX6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Atg3Q9CPX6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Atg3Q9CPX6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Atg3Q9CPX6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35,22■■■■□ 3,23
Atg3Q9CPX6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Atg3Q9CPX6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Atg3Q9CPX6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Atg3Q9CPX6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Atg3Q9CPX6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,07■■■■□ 3,2
Atg3Q9CPX6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Atg3Q9CPX6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Atg3Q9CPX6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,99■■■■□ 3,19
Atg3Q9CPX6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Atg3Q9CPX6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Atg3Q9CPX6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Atg3Q9CPX6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Atg3Q9CPX6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Atg3Q9CPX6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Atg3Q9CPX6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Atg3Q9CPX6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Atg3Q9CPX6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Atg3Q9CPX6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Atg3Q9CPX6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,8■■■■□ 3,16
Atg3Q9CPX6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
Atg3Q9CPX6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Atg3Q9CPX6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Atg3Q9CPX6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Atg3Q9CPX6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,68■■■■□ 3,14
Atg3Q9CPX6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,68■■■■□ 3,14
Atg3Q9CPX6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Atg3Q9CPX6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,65■■■■□ 3,14
Atg3Q9CPX6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Atg3Q9CPX6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Atg3Q9CPX6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Atg3Q9CPX6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Atg3Q9CPX6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Atg3Q9CPX6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Atg3Q9CPX6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34,53■■■■□ 3,12
Atg3Q9CPX6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Atg3Q9CPX6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Atg3Q9CPX6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Atg3Q9CPX6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Atg3Q9CPX6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34,45■■■■□ 3,11
Atg3Q9CPX6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Atg3Q9CPX6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Atg3Q9CPX6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Atg3Q9CPX6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Atg3Q9CPX6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Atg3Q9CPX6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Atg3Q9CPX6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Atg3Q9CPX6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Atg3Q9CPX6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34,37■■■■□ 3,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,1 ms