Protein–RNA interactions for Protein: Q99PW4

Tp53rk, TP53-regulating kinase, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53rkQ99PW4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53rkQ99PW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tp53rkQ99PW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tp53rkQ99PW4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53rkQ99PW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53rkQ99PW4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53rkQ99PW4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tp53rkQ99PW4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tp53rkQ99PW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tp53rkQ99PW4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tp53rkQ99PW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tp53rkQ99PW4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53rkQ99PW4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53rkQ99PW4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53rkQ99PW4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tp53rkQ99PW4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tp53rkQ99PW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tp53rkQ99PW4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tp53rkQ99PW4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tp53rkQ99PW4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tp53rkQ99PW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tp53rkQ99PW4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tp53rkQ99PW4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tp53rkQ99PW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tp53rkQ99PW4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tp53rkQ99PW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tp53rkQ99PW4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tp53rkQ99PW4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tp53rkQ99PW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tp53rkQ99PW4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tp53rkQ99PW4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tp53rkQ99PW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tp53rkQ99PW4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tp53rkQ99PW4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53rkQ99PW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53rkQ99PW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53rkQ99PW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tp53rkQ99PW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53rkQ99PW4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53rkQ99PW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tp53rkQ99PW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53rkQ99PW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53rkQ99PW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53rkQ99PW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tp53rkQ99PW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tp53rkQ99PW4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tp53rkQ99PW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms