Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GpnmbQ99P91 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GpnmbQ99P91 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GpnmbQ99P91 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GpnmbQ99P91 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GpnmbQ99P91 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GpnmbQ99P91 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GpnmbQ99P91 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GpnmbQ99P91 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GpnmbQ99P91 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GpnmbQ99P91 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GpnmbQ99P91 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GpnmbQ99P91 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GpnmbQ99P91 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GpnmbQ99P91 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GpnmbQ99P91 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GpnmbQ99P91 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GpnmbQ99P91 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GpnmbQ99P91 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GpnmbQ99P91 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GpnmbQ99P91 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GpnmbQ99P91 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GpnmbQ99P91 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GpnmbQ99P91 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GpnmbQ99P91 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GpnmbQ99P91 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GpnmbQ99P91 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GpnmbQ99P91 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GpnmbQ99P91 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GpnmbQ99P91 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GpnmbQ99P91 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GpnmbQ99P91 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GpnmbQ99P91 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GpnmbQ99P91 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GpnmbQ99P91 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GpnmbQ99P91 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GpnmbQ99P91 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GpnmbQ99P91 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GpnmbQ99P91 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GpnmbQ99P91 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GpnmbQ99P91 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GpnmbQ99P91 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GpnmbQ99P91 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GpnmbQ99P91 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GpnmbQ99P91 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GpnmbQ99P91 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GpnmbQ99P91 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GpnmbQ99P91 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GpnmbQ99P91 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GpnmbQ99P91 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GpnmbQ99P91 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GpnmbQ99P91 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GpnmbQ99P91 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GpnmbQ99P91 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GpnmbQ99P91 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GpnmbQ99P91 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GpnmbQ99P91 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GpnmbQ99P91 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GpnmbQ99P91 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GpnmbQ99P91 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GpnmbQ99P91 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GpnmbQ99P91 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GpnmbQ99P91 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GpnmbQ99P91 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GpnmbQ99P91 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GpnmbQ99P91 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GpnmbQ99P91 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GpnmbQ99P91 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GpnmbQ99P91 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GpnmbQ99P91 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GpnmbQ99P91 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GpnmbQ99P91 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GpnmbQ99P91 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GpnmbQ99P91 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GpnmbQ99P91 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GpnmbQ99P91 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GpnmbQ99P91 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GpnmbQ99P91 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GpnmbQ99P91 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GpnmbQ99P91 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GpnmbQ99P91 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GpnmbQ99P91 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GpnmbQ99P91 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GpnmbQ99P91 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GpnmbQ99P91 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GpnmbQ99P91 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GpnmbQ99P91 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GpnmbQ99P91 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GpnmbQ99P91 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GpnmbQ99P91 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GpnmbQ99P91 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GpnmbQ99P91 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GpnmbQ99P91 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GpnmbQ99P91 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GpnmbQ99P91 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GpnmbQ99P91 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GpnmbQ99P91 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GpnmbQ99P91 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GpnmbQ99P91 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GpnmbQ99P91 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms