Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cntnap4Q99P47 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cntnap4Q99P47 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cntnap4Q99P47 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cntnap4Q99P47 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cntnap4Q99P47 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cntnap4Q99P47 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cntnap4Q99P47 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cntnap4Q99P47 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cntnap4Q99P47 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cntnap4Q99P47 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cntnap4Q99P47 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cntnap4Q99P47 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Cntnap4Q99P47 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cntnap4Q99P47 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cntnap4Q99P47 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cntnap4Q99P47 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cntnap4Q99P47 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cntnap4Q99P47 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cntnap4Q99P47 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cntnap4Q99P47 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cntnap4Q99P47 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cntnap4Q99P47 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cntnap4Q99P47 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cntnap4Q99P47 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cntnap4Q99P47 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cntnap4Q99P47 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cntnap4Q99P47 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cntnap4Q99P47 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cntnap4Q99P47 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cntnap4Q99P47 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cntnap4Q99P47 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cntnap4Q99P47 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cntnap4Q99P47 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cntnap4Q99P47 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cntnap4Q99P47 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cntnap4Q99P47 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cntnap4Q99P47 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cntnap4Q99P47 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cntnap4Q99P47 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cntnap4Q99P47 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cntnap4Q99P47 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cntnap4Q99P47 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cntnap4Q99P47 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cntnap4Q99P47 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cntnap4Q99P47 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cntnap4Q99P47 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Cntnap4Q99P47 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cntnap4Q99P47 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cntnap4Q99P47 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cntnap4Q99P47 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cntnap4Q99P47 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cntnap4Q99P47 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cntnap4Q99P47 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cntnap4Q99P47 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cntnap4Q99P47 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cntnap4Q99P47 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cntnap4Q99P47 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cntnap4Q99P47 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cntnap4Q99P47 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cntnap4Q99P47 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cntnap4Q99P47 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cntnap4Q99P47 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cntnap4Q99P47 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cntnap4Q99P47 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cntnap4Q99P47 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cntnap4Q99P47 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cntnap4Q99P47 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cntnap4Q99P47 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cntnap4Q99P47 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cntnap4Q99P47 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cntnap4Q99P47 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cntnap4Q99P47 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cntnap4Q99P47 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cntnap4Q99P47 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cntnap4Q99P47 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cntnap4Q99P47 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cntnap4Q99P47 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cntnap4Q99P47 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cntnap4Q99P47 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cntnap4Q99P47 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cntnap4Q99P47 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cntnap4Q99P47 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cntnap4Q99P47 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cntnap4Q99P47 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cntnap4Q99P47 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cntnap4Q99P47 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cntnap4Q99P47 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cntnap4Q99P47 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cntnap4Q99P47 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cntnap4Q99P47 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cntnap4Q99P47 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cntnap4Q99P47 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cntnap4Q99P47 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cntnap4Q99P47 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cntnap4Q99P47 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cntnap4Q99P47 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cntnap4Q99P47 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cntnap4Q99P47 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cntnap4Q99P47 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms