Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atoh8Q99NA2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atoh8Q99NA2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atoh8Q99NA2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atoh8Q99NA2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atoh8Q99NA2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atoh8Q99NA2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atoh8Q99NA2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atoh8Q99NA2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atoh8Q99NA2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atoh8Q99NA2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atoh8Q99NA2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atoh8Q99NA2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atoh8Q99NA2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atoh8Q99NA2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atoh8Q99NA2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atoh8Q99NA2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atoh8Q99NA2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atoh8Q99NA2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atoh8Q99NA2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atoh8Q99NA2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Atoh8Q99NA2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atoh8Q99NA2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
Atoh8Q99NA2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atoh8Q99NA2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atoh8Q99NA2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atoh8Q99NA2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atoh8Q99NA2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atoh8Q99NA2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atoh8Q99NA2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atoh8Q99NA2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atoh8Q99NA2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atoh8Q99NA2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atoh8Q99NA2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atoh8Q99NA2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atoh8Q99NA2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atoh8Q99NA2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atoh8Q99NA2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Atoh8Q99NA2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Atoh8Q99NA2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atoh8Q99NA2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atoh8Q99NA2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Atoh8Q99NA2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Atoh8Q99NA2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atoh8Q99NA2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atoh8Q99NA2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Atoh8Q99NA2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atoh8Q99NA2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atoh8Q99NA2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atoh8Q99NA2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atoh8Q99NA2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atoh8Q99NA2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atoh8Q99NA2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atoh8Q99NA2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atoh8Q99NA2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Atoh8Q99NA2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atoh8Q99NA2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atoh8Q99NA2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atoh8Q99NA2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atoh8Q99NA2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atoh8Q99NA2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atoh8Q99NA2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atoh8Q99NA2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atoh8Q99NA2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atoh8Q99NA2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atoh8Q99NA2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atoh8Q99NA2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atoh8Q99NA2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atoh8Q99NA2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Atoh8Q99NA2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atoh8Q99NA2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atoh8Q99NA2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atoh8Q99NA2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Atoh8Q99NA2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atoh8Q99NA2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atoh8Q99NA2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atoh8Q99NA2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atoh8Q99NA2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atoh8Q99NA2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atoh8Q99NA2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atoh8Q99NA2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atoh8Q99NA2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atoh8Q99NA2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atoh8Q99NA2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atoh8Q99NA2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atoh8Q99NA2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atoh8Q99NA2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atoh8Q99NA2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atoh8Q99NA2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atoh8Q99NA2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Atoh8Q99NA2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atoh8Q99NA2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Atoh8Q99NA2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atoh8Q99NA2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atoh8Q99NA2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atoh8Q99NA2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atoh8Q99NA2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atoh8Q99NA2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atoh8Q99NA2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atoh8Q99NA2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms