Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col25a1Q99MQ5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col25a1Q99MQ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col25a1Q99MQ5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col25a1Q99MQ5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col25a1Q99MQ5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col25a1Q99MQ5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col25a1Q99MQ5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col25a1Q99MQ5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col25a1Q99MQ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col25a1Q99MQ5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col25a1Q99MQ5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col25a1Q99MQ5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col25a1Q99MQ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col25a1Q99MQ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col25a1Q99MQ5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col25a1Q99MQ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col25a1Q99MQ5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col25a1Q99MQ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col25a1Q99MQ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col25a1Q99MQ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col25a1Q99MQ5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col25a1Q99MQ5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col25a1Q99MQ5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col25a1Q99MQ5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Col25a1Q99MQ5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col25a1Q99MQ5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col25a1Q99MQ5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col25a1Q99MQ5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col25a1Q99MQ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col25a1Q99MQ5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col25a1Q99MQ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col25a1Q99MQ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Col25a1Q99MQ5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col25a1Q99MQ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col25a1Q99MQ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col25a1Q99MQ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col25a1Q99MQ5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col25a1Q99MQ5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col25a1Q99MQ5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col25a1Q99MQ5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col25a1Q99MQ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col25a1Q99MQ5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col25a1Q99MQ5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col25a1Q99MQ5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col25a1Q99MQ5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Col25a1Q99MQ5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col25a1Q99MQ5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col25a1Q99MQ5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Col25a1Q99MQ5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Col25a1Q99MQ5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col25a1Q99MQ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col25a1Q99MQ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col25a1Q99MQ5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col25a1Q99MQ5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col25a1Q99MQ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col25a1Q99MQ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col25a1Q99MQ5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col25a1Q99MQ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col25a1Q99MQ5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col25a1Q99MQ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col25a1Q99MQ5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col25a1Q99MQ5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col25a1Q99MQ5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col25a1Q99MQ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col25a1Q99MQ5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col25a1Q99MQ5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Col25a1Q99MQ5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col25a1Q99MQ5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col25a1Q99MQ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col25a1Q99MQ5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col25a1Q99MQ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col25a1Q99MQ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col25a1Q99MQ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col25a1Q99MQ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col25a1Q99MQ5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col25a1Q99MQ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col25a1Q99MQ5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col25a1Q99MQ5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col25a1Q99MQ5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col25a1Q99MQ5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col25a1Q99MQ5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col25a1Q99MQ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col25a1Q99MQ5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col25a1Q99MQ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col25a1Q99MQ5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col25a1Q99MQ5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col25a1Q99MQ5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col25a1Q99MQ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col25a1Q99MQ5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col25a1Q99MQ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col25a1Q99MQ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col25a1Q99MQ5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Col25a1Q99MQ5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col25a1Q99MQ5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col25a1Q99MQ5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col25a1Q99MQ5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col25a1Q99MQ5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col25a1Q99MQ5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col25a1Q99MQ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms