Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbc3Q99ML1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbc3Q99ML1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bbc3Q99ML1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bbc3Q99ML1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bbc3Q99ML1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bbc3Q99ML1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bbc3Q99ML1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bbc3Q99ML1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bbc3Q99ML1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bbc3Q99ML1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bbc3Q99ML1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bbc3Q99ML1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bbc3Q99ML1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bbc3Q99ML1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bbc3Q99ML1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bbc3Q99ML1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bbc3Q99ML1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bbc3Q99ML1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bbc3Q99ML1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Bbc3Q99ML1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bbc3Q99ML1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bbc3Q99ML1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bbc3Q99ML1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bbc3Q99ML1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bbc3Q99ML1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bbc3Q99ML1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bbc3Q99ML1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bbc3Q99ML1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bbc3Q99ML1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Bbc3Q99ML1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Bbc3Q99ML1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bbc3Q99ML1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bbc3Q99ML1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bbc3Q99ML1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bbc3Q99ML1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bbc3Q99ML1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bbc3Q99ML1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bbc3Q99ML1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Bbc3Q99ML1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Bbc3Q99ML1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bbc3Q99ML1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bbc3Q99ML1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bbc3Q99ML1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Bbc3Q99ML1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bbc3Q99ML1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bbc3Q99ML1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bbc3Q99ML1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Bbc3Q99ML1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bbc3Q99ML1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bbc3Q99ML1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bbc3Q99ML1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bbc3Q99ML1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bbc3Q99ML1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bbc3Q99ML1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bbc3Q99ML1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bbc3Q99ML1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bbc3Q99ML1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bbc3Q99ML1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bbc3Q99ML1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Bbc3Q99ML1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bbc3Q99ML1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bbc3Q99ML1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbc3Q99ML1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbc3Q99ML1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbc3Q99ML1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbc3Q99ML1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbc3Q99ML1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbc3Q99ML1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbc3Q99ML1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bbc3Q99ML1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbc3Q99ML1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Bbc3Q99ML1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bbc3Q99ML1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbc3Q99ML1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbc3Q99ML1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbc3Q99ML1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bbc3Q99ML1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bbc3Q99ML1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bbc3Q99ML1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bbc3Q99ML1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Bbc3Q99ML1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bbc3Q99ML1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bbc3Q99ML1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbc3Q99ML1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbc3Q99ML1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bbc3Q99ML1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bbc3Q99ML1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bbc3Q99ML1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bbc3Q99ML1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bbc3Q99ML1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bbc3Q99ML1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bbc3Q99ML1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bbc3Q99ML1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbc3Q99ML1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbc3Q99ML1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bbc3Q99ML1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bbc3Q99ML1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbc3Q99ML1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbc3Q99ML1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms