Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ6

Pdzd3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd3Q99MJ6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Pdzd3Q99MJ6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Pdzd3Q99MJ6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Pdzd3Q99MJ6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Pdzd3Q99MJ6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Pdzd3Q99MJ6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Pdzd3Q99MJ6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Pdzd3Q99MJ6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Pdzd3Q99MJ6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Pdzd3Q99MJ6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Pdzd3Q99MJ6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Pdzd3Q99MJ6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Pdzd3Q99MJ6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Pdzd3Q99MJ6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,36
Pdzd3Q99MJ6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Pdzd3Q99MJ6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Pdzd3Q99MJ6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Pdzd3Q99MJ6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Pdzd3Q99MJ6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Pdzd3Q99MJ6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Pdzd3Q99MJ6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Pdzd3Q99MJ6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Pdzd3Q99MJ6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Pdzd3Q99MJ6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Pdzd3Q99MJ6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Pdzd3Q99MJ6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Pdzd3Q99MJ6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Pdzd3Q99MJ6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Pdzd3Q99MJ6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Pdzd3Q99MJ6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Pdzd3Q99MJ6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Pdzd3Q99MJ6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Pdzd3Q99MJ6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Pdzd3Q99MJ6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Pdzd3Q99MJ6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Pdzd3Q99MJ6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Pdzd3Q99MJ6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Pdzd3Q99MJ6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Pdzd3Q99MJ6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Pdzd3Q99MJ6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Pdzd3Q99MJ6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Pdzd3Q99MJ6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Pdzd3Q99MJ6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Pdzd3Q99MJ6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Pdzd3Q99MJ6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Pdzd3Q99MJ6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Pdzd3Q99MJ6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Pdzd3Q99MJ6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Pdzd3Q99MJ6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Pdzd3Q99MJ6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Pdzd3Q99MJ6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Pdzd3Q99MJ6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Pdzd3Q99MJ6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Pdzd3Q99MJ6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Pdzd3Q99MJ6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Pdzd3Q99MJ6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Pdzd3Q99MJ6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Pdzd3Q99MJ6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Pdzd3Q99MJ6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Pdzd3Q99MJ6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Pdzd3Q99MJ6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Pdzd3Q99MJ6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Pdzd3Q99MJ6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Pdzd3Q99MJ6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Pdzd3Q99MJ6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Pdzd3Q99MJ6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Pdzd3Q99MJ6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Pdzd3Q99MJ6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Pdzd3Q99MJ6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Pdzd3Q99MJ6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Pdzd3Q99MJ6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Pdzd3Q99MJ6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Pdzd3Q99MJ6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Pdzd3Q99MJ6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Pdzd3Q99MJ6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Pdzd3Q99MJ6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Pdzd3Q99MJ6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Pdzd3Q99MJ6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Pdzd3Q99MJ6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Pdzd3Q99MJ6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Pdzd3Q99MJ6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Pdzd3Q99MJ6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Pdzd3Q99MJ6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Pdzd3Q99MJ6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Pdzd3Q99MJ6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Pdzd3Q99MJ6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Pdzd3Q99MJ6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Pdzd3Q99MJ6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Pdzd3Q99MJ6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Pdzd3Q99MJ6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Pdzd3Q99MJ6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Pdzd3Q99MJ6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Pdzd3Q99MJ6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Pdzd3Q99MJ6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Pdzd3Q99MJ6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Pdzd3Q99MJ6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Pdzd3Q99MJ6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Pdzd3Q99MJ6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Pdzd3Q99MJ6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Pdzd3Q99MJ6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms