Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp1b1Q99LU0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp1b1Q99LU0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp1b1Q99LU0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp1b1Q99LU0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp1b1Q99LU0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp1b1Q99LU0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp1b1Q99LU0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp1b1Q99LU0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp1b1Q99LU0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp1b1Q99LU0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp1b1Q99LU0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp1b1Q99LU0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp1b1Q99LU0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chmp1b1Q99LU0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp1b1Q99LU0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp1b1Q99LU0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp1b1Q99LU0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chmp1b1Q99LU0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp1b1Q99LU0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp1b1Q99LU0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp1b1Q99LU0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp1b1Q99LU0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp1b1Q99LU0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp1b1Q99LU0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp1b1Q99LU0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp1b1Q99LU0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp1b1Q99LU0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp1b1Q99LU0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp1b1Q99LU0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp1b1Q99LU0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp1b1Q99LU0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chmp1b1Q99LU0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp1b1Q99LU0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp1b1Q99LU0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp1b1Q99LU0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp1b1Q99LU0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp1b1Q99LU0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp1b1Q99LU0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp1b1Q99LU0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp1b1Q99LU0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp1b1Q99LU0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp1b1Q99LU0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp1b1Q99LU0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp1b1Q99LU0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp1b1Q99LU0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp1b1Q99LU0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp1b1Q99LU0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp1b1Q99LU0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chmp1b1Q99LU0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp1b1Q99LU0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp1b1Q99LU0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp1b1Q99LU0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp1b1Q99LU0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp1b1Q99LU0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp1b1Q99LU0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp1b1Q99LU0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp1b1Q99LU0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp1b1Q99LU0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp1b1Q99LU0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp1b1Q99LU0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp1b1Q99LU0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp1b1Q99LU0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp1b1Q99LU0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp1b1Q99LU0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp1b1Q99LU0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp1b1Q99LU0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp1b1Q99LU0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp1b1Q99LU0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp1b1Q99LU0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp1b1Q99LU0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp1b1Q99LU0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp1b1Q99LU0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp1b1Q99LU0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp1b1Q99LU0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp1b1Q99LU0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp1b1Q99LU0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp1b1Q99LU0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp1b1Q99LU0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp1b1Q99LU0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp1b1Q99LU0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp1b1Q99LU0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp1b1Q99LU0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp1b1Q99LU0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp1b1Q99LU0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp1b1Q99LU0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp1b1Q99LU0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp1b1Q99LU0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp1b1Q99LU0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp1b1Q99LU0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp1b1Q99LU0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp1b1Q99LU0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp1b1Q99LU0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chmp1b1Q99LU0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp1b1Q99LU0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms