Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF1

Akirin1, Akirin-1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akirin1Q99LF1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Akirin1Q99LF1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Akirin1Q99LF1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Akirin1Q99LF1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Akirin1Q99LF1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Akirin1Q99LF1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Akirin1Q99LF1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Akirin1Q99LF1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Akirin1Q99LF1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Akirin1Q99LF1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Akirin1Q99LF1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Akirin1Q99LF1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Akirin1Q99LF1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Akirin1Q99LF1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Akirin1Q99LF1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Akirin1Q99LF1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Akirin1Q99LF1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Akirin1Q99LF1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Akirin1Q99LF1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Akirin1Q99LF1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Akirin1Q99LF1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Akirin1Q99LF1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Akirin1Q99LF1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Akirin1Q99LF1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Akirin1Q99LF1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Akirin1Q99LF1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Akirin1Q99LF1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Akirin1Q99LF1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Akirin1Q99LF1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Akirin1Q99LF1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Akirin1Q99LF1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Akirin1Q99LF1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Akirin1Q99LF1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Akirin1Q99LF1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Akirin1Q99LF1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Akirin1Q99LF1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Akirin1Q99LF1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Akirin1Q99LF1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Akirin1Q99LF1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Akirin1Q99LF1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Akirin1Q99LF1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Akirin1Q99LF1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Akirin1Q99LF1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Akirin1Q99LF1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Akirin1Q99LF1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Akirin1Q99LF1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Akirin1Q99LF1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Akirin1Q99LF1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Akirin1Q99LF1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Akirin1Q99LF1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Akirin1Q99LF1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Akirin1Q99LF1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Akirin1Q99LF1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Akirin1Q99LF1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Akirin1Q99LF1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Akirin1Q99LF1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Akirin1Q99LF1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Akirin1Q99LF1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Akirin1Q99LF1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Akirin1Q99LF1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Akirin1Q99LF1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Akirin1Q99LF1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Akirin1Q99LF1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Akirin1Q99LF1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Akirin1Q99LF1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Akirin1Q99LF1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Akirin1Q99LF1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Akirin1Q99LF1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Akirin1Q99LF1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Akirin1Q99LF1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Akirin1Q99LF1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Akirin1Q99LF1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Akirin1Q99LF1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Akirin1Q99LF1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Akirin1Q99LF1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Akirin1Q99LF1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Akirin1Q99LF1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Akirin1Q99LF1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Akirin1Q99LF1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Akirin1Q99LF1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Akirin1Q99LF1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Akirin1Q99LF1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Akirin1Q99LF1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Akirin1Q99LF1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Akirin1Q99LF1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Akirin1Q99LF1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Akirin1Q99LF1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Akirin1Q99LF1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Akirin1Q99LF1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Akirin1Q99LF1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Akirin1Q99LF1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Akirin1Q99LF1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Akirin1Q99LF1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Akirin1Q99LF1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Akirin1Q99LF1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Akirin1Q99LF1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Akirin1Q99LF1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Akirin1Q99LF1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Akirin1Q99LF1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Akirin1Q99LF1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms