Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arrdc1Q99KN1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arrdc1Q99KN1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arrdc1Q99KN1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arrdc1Q99KN1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arrdc1Q99KN1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arrdc1Q99KN1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arrdc1Q99KN1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arrdc1Q99KN1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arrdc1Q99KN1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arrdc1Q99KN1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arrdc1Q99KN1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arrdc1Q99KN1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arrdc1Q99KN1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arrdc1Q99KN1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arrdc1Q99KN1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arrdc1Q99KN1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arrdc1Q99KN1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arrdc1Q99KN1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arrdc1Q99KN1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arrdc1Q99KN1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arrdc1Q99KN1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arrdc1Q99KN1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Arrdc1Q99KN1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arrdc1Q99KN1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arrdc1Q99KN1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arrdc1Q99KN1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arrdc1Q99KN1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Arrdc1Q99KN1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arrdc1Q99KN1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arrdc1Q99KN1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arrdc1Q99KN1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arrdc1Q99KN1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arrdc1Q99KN1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arrdc1Q99KN1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arrdc1Q99KN1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arrdc1Q99KN1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Arrdc1Q99KN1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arrdc1Q99KN1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arrdc1Q99KN1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arrdc1Q99KN1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arrdc1Q99KN1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arrdc1Q99KN1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arrdc1Q99KN1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arrdc1Q99KN1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arrdc1Q99KN1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arrdc1Q99KN1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Arrdc1Q99KN1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arrdc1Q99KN1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arrdc1Q99KN1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arrdc1Q99KN1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arrdc1Q99KN1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arrdc1Q99KN1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arrdc1Q99KN1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arrdc1Q99KN1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arrdc1Q99KN1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Arrdc1Q99KN1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arrdc1Q99KN1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arrdc1Q99KN1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arrdc1Q99KN1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arrdc1Q99KN1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arrdc1Q99KN1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arrdc1Q99KN1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arrdc1Q99KN1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arrdc1Q99KN1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arrdc1Q99KN1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arrdc1Q99KN1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arrdc1Q99KN1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arrdc1Q99KN1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arrdc1Q99KN1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arrdc1Q99KN1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arrdc1Q99KN1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arrdc1Q99KN1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arrdc1Q99KN1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arrdc1Q99KN1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arrdc1Q99KN1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arrdc1Q99KN1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arrdc1Q99KN1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arrdc1Q99KN1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arrdc1Q99KN1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arrdc1Q99KN1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arrdc1Q99KN1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arrdc1Q99KN1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arrdc1Q99KN1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arrdc1Q99KN1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arrdc1Q99KN1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arrdc1Q99KN1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Arrdc1Q99KN1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arrdc1Q99KN1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arrdc1Q99KN1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arrdc1Q99KN1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arrdc1Q99KN1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arrdc1Q99KN1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arrdc1Q99KN1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arrdc1Q99KN1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arrdc1Q99KN1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Arrdc1Q99KN1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arrdc1Q99KN1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arrdc1Q99KN1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arrdc1Q99KN1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms