Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Ophn1Q99J31 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Ophn1Q99J31 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Ophn1Q99J31 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Ophn1Q99J31 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Ophn1Q99J31 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Ophn1Q99J31 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Ophn1Q99J31 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Ophn1Q99J31 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ophn1Q99J31 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ophn1Q99J31 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Ophn1Q99J31 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ophn1Q99J31 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ophn1Q99J31 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Ophn1Q99J31 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ophn1Q99J31 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Ophn1Q99J31 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ophn1Q99J31 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ophn1Q99J31 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Ophn1Q99J31 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ophn1Q99J31 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ophn1Q99J31 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Ophn1Q99J31 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Ophn1Q99J31 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Ophn1Q99J31 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ophn1Q99J31 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Ophn1Q99J31 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Ophn1Q99J31 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ophn1Q99J31 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ophn1Q99J31 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Ophn1Q99J31 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ophn1Q99J31 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ophn1Q99J31 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Ophn1Q99J31 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ophn1Q99J31 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ophn1Q99J31 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ophn1Q99J31 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ophn1Q99J31 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ophn1Q99J31 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ophn1Q99J31 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ophn1Q99J31 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ophn1Q99J31 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ophn1Q99J31 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ophn1Q99J31 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ophn1Q99J31 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ophn1Q99J31 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ophn1Q99J31 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ophn1Q99J31 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Ophn1Q99J31 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ophn1Q99J31 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ophn1Q99J31 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ophn1Q99J31 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ophn1Q99J31 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ophn1Q99J31 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ophn1Q99J31 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ophn1Q99J31 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ophn1Q99J31 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ophn1Q99J31 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ophn1Q99J31 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ophn1Q99J31 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ophn1Q99J31 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ophn1Q99J31 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Ophn1Q99J31 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ophn1Q99J31 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ophn1Q99J31 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Ophn1Q99J31 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ophn1Q99J31 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ophn1Q99J31 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ophn1Q99J31 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ophn1Q99J31 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ophn1Q99J31 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ophn1Q99J31 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ophn1Q99J31 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ophn1Q99J31 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ophn1Q99J31 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ophn1Q99J31 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ophn1Q99J31 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ophn1Q99J31 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ophn1Q99J31 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Ophn1Q99J31 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ophn1Q99J31 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ophn1Q99J31 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ophn1Q99J31 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ophn1Q99J31 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ophn1Q99J31 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
Ophn1Q99J31 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Ophn1Q99J31 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ophn1Q99J31 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ophn1Q99J31 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ophn1Q99J31 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ophn1Q99J31 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ophn1Q99J31 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ophn1Q99J31 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
Ophn1Q99J31 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ophn1Q99J31 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Ophn1Q99J31 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Ophn1Q99J31 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ophn1Q99J31 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ophn1Q99J31 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ophn1Q99J31 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms