Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
CsprsQ99388 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
CsprsQ99388 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
CsprsQ99388 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
CsprsQ99388 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
CsprsQ99388 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,32■■□□□ 1,32
CsprsQ99388 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,31■■□□□ 1,32
CsprsQ99388 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
CsprsQ99388 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
CsprsQ99388 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
CsprsQ99388 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
CsprsQ99388 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,27■■□□□ 1,32
CsprsQ99388 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
CsprsQ99388 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
CsprsQ99388 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
CsprsQ99388 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,25■■□□□ 1,31
CsprsQ99388 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
CsprsQ99388 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,22■■□□□ 1,31
CsprsQ99388 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
CsprsQ99388 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
CsprsQ99388 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
CsprsQ99388 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
CsprsQ99388 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,08■■□□□ 1,29
CsprsQ99388 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
CsprsQ99388 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
CsprsQ99388 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
CsprsQ99388 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
CsprsQ99388 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
CsprsQ99388 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
CsprsQ99388 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
CsprsQ99388 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
CsprsQ99388 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
CsprsQ99388 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
CsprsQ99388 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,86■■□□□ 1,25
CsprsQ99388 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
CsprsQ99388 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
CsprsQ99388 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
CsprsQ99388 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22,79■■□□□ 1,24
CsprsQ99388 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
CsprsQ99388 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
CsprsQ99388 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
CsprsQ99388 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
CsprsQ99388 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
CsprsQ99388 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,77■■□□□ 1,24
CsprsQ99388 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22,75■■□□□ 1,23
CsprsQ99388 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,74■■□□□ 1,23
CsprsQ99388 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,68■■□□□ 1,22
CsprsQ99388 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
CsprsQ99388 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
CsprsQ99388 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,64■■□□□ 1,21
CsprsQ99388 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
CsprsQ99388 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
CsprsQ99388 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
CsprsQ99388 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
CsprsQ99388 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22,54■■□□□ 1,2
CsprsQ99388 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
CsprsQ99388 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22,52■■□□□ 1,2
CsprsQ99388 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
CsprsQ99388 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
CsprsQ99388 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
CsprsQ99388 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
CsprsQ99388 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
CsprsQ99388 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
CsprsQ99388 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
CsprsQ99388 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
CsprsQ99388 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
CsprsQ99388 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
CsprsQ99388 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
CsprsQ99388 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
CsprsQ99388 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
CsprsQ99388 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
CsprsQ99388 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,41■■□□□ 1,18
CsprsQ99388 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
CsprsQ99388 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
CsprsQ99388 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
CsprsQ99388 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
CsprsQ99388 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,39■■□□□ 1,17
CsprsQ99388 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
CsprsQ99388 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,37■■□□□ 1,17
CsprsQ99388 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
CsprsQ99388 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
CsprsQ99388 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,33■■□□□ 1,17
CsprsQ99388 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22,33■■□□□ 1,17
CsprsQ99388 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
CsprsQ99388 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,32■■□□□ 1,16
CsprsQ99388 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22,31■■□□□ 1,16
CsprsQ99388 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
CsprsQ99388 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
CsprsQ99388 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
CsprsQ99388 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
CsprsQ99388 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
CsprsQ99388 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
CsprsQ99388 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,28■■□□□ 1,16
CsprsQ99388 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22,27■■□□□ 1,16
CsprsQ99388 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,27■■□□□ 1,15
CsprsQ99388 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22,25■■□□□ 1,15
CsprsQ99388 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22,25■■□□□ 1,15
CsprsQ99388 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,24■■□□□ 1,15
CsprsQ99388 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,23■■□□□ 1,15
CsprsQ99388 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,8 ms