Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtn4ip1Q924D0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtn4ip1Q924D0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtn4ip1Q924D0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtn4ip1Q924D0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4ip1Q924D0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4ip1Q924D0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4ip1Q924D0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4ip1Q924D0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4ip1Q924D0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtn4ip1Q924D0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtn4ip1Q924D0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtn4ip1Q924D0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4ip1Q924D0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4ip1Q924D0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtn4ip1Q924D0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4ip1Q924D0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4ip1Q924D0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4ip1Q924D0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4ip1Q924D0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4ip1Q924D0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4ip1Q924D0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4ip1Q924D0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rtn4ip1Q924D0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4ip1Q924D0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4ip1Q924D0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4ip1Q924D0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4ip1Q924D0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4ip1Q924D0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4ip1Q924D0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4ip1Q924D0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4ip1Q924D0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4ip1Q924D0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4ip1Q924D0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtn4ip1Q924D0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4ip1Q924D0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtn4ip1Q924D0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4ip1Q924D0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4ip1Q924D0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtn4ip1Q924D0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtn4ip1Q924D0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtn4ip1Q924D0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtn4ip1Q924D0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtn4ip1Q924D0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtn4ip1Q924D0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtn4ip1Q924D0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtn4ip1Q924D0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4ip1Q924D0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4ip1Q924D0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4ip1Q924D0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4ip1Q924D0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4ip1Q924D0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4ip1Q924D0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtn4ip1Q924D0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4ip1Q924D0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4ip1Q924D0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4ip1Q924D0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4ip1Q924D0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4ip1Q924D0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4ip1Q924D0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4ip1Q924D0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4ip1Q924D0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4ip1Q924D0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4ip1Q924D0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4ip1Q924D0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4ip1Q924D0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtn4ip1Q924D0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtn4ip1Q924D0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4ip1Q924D0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4ip1Q924D0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4ip1Q924D0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4ip1Q924D0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4ip1Q924D0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtn4ip1Q924D0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtn4ip1Q924D0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtn4ip1Q924D0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtn4ip1Q924D0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtn4ip1Q924D0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtn4ip1Q924D0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtn4ip1Q924D0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtn4ip1Q924D0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtn4ip1Q924D0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rtn4ip1Q924D0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4ip1Q924D0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4ip1Q924D0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtn4ip1Q924D0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4ip1Q924D0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4ip1Q924D0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4ip1Q924D0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4ip1Q924D0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4ip1Q924D0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtn4ip1Q924D0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtn4ip1Q924D0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtn4ip1Q924D0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4ip1Q924D0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4ip1Q924D0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4ip1Q924D0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4ip1Q924D0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4ip1Q924D0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4ip1Q924D0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms