Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Tubb6Q922F4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Tubb6Q922F4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Tubb6Q922F4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Tubb6Q922F4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Tubb6Q922F4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Tubb6Q922F4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Tubb6Q922F4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Tubb6Q922F4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Tubb6Q922F4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Tubb6Q922F4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
Tubb6Q922F4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Tubb6Q922F4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,13■■■□□ 2,73
Tubb6Q922F4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Tubb6Q922F4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Tubb6Q922F4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Tubb6Q922F4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Tubb6Q922F4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Tubb6Q922F4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Tubb6Q922F4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Tubb6Q922F4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Tubb6Q922F4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2,71
Tubb6Q922F4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Tubb6Q922F4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Tubb6Q922F4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Tubb6Q922F4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Tubb6Q922F4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Tubb6Q922F4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Tubb6Q922F4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Tubb6Q922F4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,89■■■□□ 2,7
Tubb6Q922F4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Tubb6Q922F4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Tubb6Q922F4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Tubb6Q922F4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Tubb6Q922F4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Tubb6Q922F4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Tubb6Q922F4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Tubb6Q922F4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Tubb6Q922F4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Tubb6Q922F4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Tubb6Q922F4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Tubb6Q922F4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Tubb6Q922F4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Tubb6Q922F4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Tubb6Q922F4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Tubb6Q922F4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Tubb6Q922F4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Tubb6Q922F4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Tubb6Q922F4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Tubb6Q922F4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Tubb6Q922F4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,61■■■□□ 2,65
Tubb6Q922F4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Tubb6Q922F4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Tubb6Q922F4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Tubb6Q922F4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Tubb6Q922F4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Tubb6Q922F4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Tubb6Q922F4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Tubb6Q922F4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Tubb6Q922F4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Tubb6Q922F4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Tubb6Q922F4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Tubb6Q922F4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Tubb6Q922F4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Tubb6Q922F4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Tubb6Q922F4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Tubb6Q922F4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Tubb6Q922F4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
Tubb6Q922F4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Tubb6Q922F4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Tubb6Q922F4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Tubb6Q922F4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Tubb6Q922F4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Tubb6Q922F4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Tubb6Q922F4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Tubb6Q922F4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Tubb6Q922F4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Tubb6Q922F4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Tubb6Q922F4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Tubb6Q922F4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Tubb6Q922F4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31,03■■■□□ 2,56
Tubb6Q922F4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Tubb6Q922F4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31■■■□□ 2,55
Tubb6Q922F4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Tubb6Q922F4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Tubb6Q922F4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Tubb6Q922F4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Tubb6Q922F4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,89■■■□□ 2,54
Tubb6Q922F4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Tubb6Q922F4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Tubb6Q922F4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Tubb6Q922F4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Tubb6Q922F4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Tubb6Q922F4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Tubb6Q922F4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Tubb6Q922F4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Tubb6Q922F4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Tubb6Q922F4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Tubb6Q922F4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Tubb6Q922F4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms